Kỹ năng giúp thiết lập, chạy mô phỏng MD protein/ligand bằng OpenMM và phân tích quỹ đạo bằng MDAnalysis.
Kỹ năng giúp thiết kế, dựng và kiểm tra hình khoa học trung thực, dễ tiếp cận, đạt chuẩn xuất bản bằng Matplotlib, Seaborn hoặc Plotly.
Skill hướng dẫn Claude dùng arboreto (GRNBoost2/GENIE3) để suy luận mạng điều hòa gen từ dữ liệu biểu hiện gen.
Tra cứu điểm AVI đã tính sẵn từ AlphaGenome Atlas và gọi trực tiếp mô hình AlphaGenome để xếp hạng, giải thích cơ chế của các biến thể đơn nucleotide vùng không mã hoá/điều hoà.
Gửi truy vấn TRAPI có giới hạn (một bước hoặc hai bước ghim hai đầu) tới API ARAX của NCATS Translator để lấy quan hệ y sinh kèm nguồn gốc bằng chứng.
Skill nghiên cứu giúp tiền xử lý và phân tích ECG, EDA, RSP bằng NeuroKit2 0.2.13 theo cách tái lập được.
Kỹ năng hướng dẫn Claude truy vấn và phân tích dữ liệu single-cell/spatial công khai quy mô hơn 200 triệu tế bào từ CZ CELLxGENE Census mà không cần tải toàn bộ dataset.
Skill hướng dẫn Claude đăng ký, kiểm định, truy vấn dữ liệu sinh học và theo dõi lineage bằng LaminDB.
Skill Claude giúp truy vấn bộ dữ liệu 1000 Genomes (3.202 mẫu giải trình tự toàn hệ gen, GRCh38) ở mức từng cá thể và từng biến thể.
Skill hướng dẫn Claude thực hiện toàn bộ quy trình RNA velocity bằng scVelo: suy luận hướng chuyển trạng thái tế bào, latent time và gene điều khiển từ dữ liệu scRNA-seq.
Skill hướng dẫn dùng pymoo để định nghĩa bài toán tối ưu một/đa/nhiều mục tiêu, tìm mặt Pareto và chọn giải pháp cuối cùng.
Skill chuyên sâu giúp huấn luyện, đánh giá và báo cáo mô hình phân tích sống còn (dữ liệu kiểm duyệt phải, rủi ro cạnh tranh) bằng scikit-survival mà không rò rỉ dữ liệu.
Skill nghiên cứu giúp dùng PathML 3.0.5 để tile ảnh WSI, xây pipeline tiền xử lý/QC, định lượng multiplex, tạo đồ thị không gian và lập kế hoạch suy luận cục bộ an toàn.
Kỹ năng hướng dẫn mô phỏng và kiểm định hệ lượng tử kín/mở bằng QuTiP 5.3, với đơn vị, chiều Hilbert và hội tụ số được nêu rõ.
Skill giúp dùng PyTDC 1.1.15 để khám phá dataset, chia tập, tính metric, chạy benchmark group và oracle phân tử một cách có kiểm soát và cần phê duyệt trước khi tải.
Tự động hóa pipeline chuẩn: căn chỉnh MAFFT → dựng cây IQ-TREE 2/FastTree → phân tích và trực quan hóa bằng ETE3.
Kiểm tra cấu hình, dữ liệu, chi phí và quyền riêng tư tại máy trước khi chạy HypoGeniC/HypoRefine để sinh giả thuyết từ dữ liệu văn bản có nhãn.
Skill sàng lọc thư viện hợp chất bằng quy tắc drug-likeness (Lipinski, Veber, CNS), cảnh báo cấu trúc PAINS/NIBR, chỉ số phức tạp và ngôn ngữ truy vấn medchem.
Skill quét vị trí N-/O-glycosylation trong chuỗi protein và hướng dẫn chiến lược glycoengineering cho kháng thể, vaccine.
Kỹ năng lập kế hoạch, kiểm chứng, khởi động lại và phân tích mô phỏng CFD bằng FluidSim 0.9 với các cổng kiểm tra số học nghiêm ngặt.