Phân tích & thiết kế glycosylation protein
Skill quét vị trí N-/O-glycosylation trong chuỗi protein và hướng dẫn chiến lược glycoengineering cho kháng thể, vaccine.
Dữ liệu · Phân tíchNâng cao★ 33,030⑂ 3,248Điểm AI 8/10Cập nhật lần cuối: 9 thg 8, 2026
Skill này làm được gì
- Quét chuỗi acid amin để tìm sequon N-glycosylation (N-X-S/T, X ≠ Pro), trả về vị trí 1-based, motif và ngữ cảnh xung quanh.
- Cung cấp hàm loại bỏ site glycosylation (Asn→Gln) hoặc thêm site mới bằng đột biến có kiểm soát.
- Dự đoán hotspot O-glycosylation theo heuristic mật độ Ser/Thr, loại bỏ motif TP/SP ức chế GalNAc-T.
- Tổng hợp công cụ ngoài: NetNGlyc/NetOGlyc, GlycoShield-MD, GlycoWorkbench, GlyConnect (kèm code gọi API), UniCarbKB, GlyTouCan.
- Bảng chiến lược theo mục tiêu: tăng ADCC (afucosylation), kéo dài bán thải (sialylation), giảm tính sinh miễn dịch, tạo glycan shield; kèm các đột biến phổ biến (N297A/Q, T299A, S298A/E333A/K334A...).
Phù hợp với ai
- Nhà nghiên cứu sinh phẩm tối ưu glycan vùng Fc của kháng thể điều trị
- Nhóm thiết kế kháng nguyên vaccine cần dựng glycan shield che epitope
- Chuyên viên phân tích biosimilar so sánh profile glycan
- Chuyên gia tin sinh học xử lý dữ liệu glycoprotein
Ví dụ sử dụng
- "Quét chuỗi Fc IgG1 này và liệt kê toàn bộ sequon N-glycosylation" → danh sách vị trí kèm thống kê NXS/NXT.
- "Tạo biến thể aglycosyl bằng cách đổi Asn297 thành Gln" → chuỗi đột biến và lưu ý kèm theo.
- "Tra dữ liệu glycosylation đã xác thực thực nghiệm của EGFR (P00533) trên GlyConnect" → gọi API và tóm tắt kết quả.
· · · Hướng dẫn cài đặt · · ·
Dùng thử ngay, không cần cài
Dán đoạn dưới vào Claude là dùng được skill này mà không cần cài đặt.
Hãy đọc hướng dẫn trong tệp này và làm theo để giúp mình: https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/glycoengineering/SKILL.md Mình muốn: (viết việc bạn cần ở đây)
Nếu Claude không mở được liên kết, hãy mở liên kết và copy nội dung vào rồi dán.
↓ Thấy hữu ích thì tải ZIP bên dưới và cài. Sau đó skill tự chạy, không phải dán lại mỗi lần.
Cài vào ứng dụng Claude (không cần terminal)
- Tải tệp ZIP bằng nút bên dưới.
- Trong Claude, mở Settings → Capabilities và bật 'Code execution and file creation'. (chỉ một lần)
- Vào Customize → Skills → + → 'Upload a skill' rồi tải tệp ZIP lên.
Cài vào Claude Code
Để Claude làm — dán câu dưới đây vào Claude Code
Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart. Copy thư mục skills/glycoengineering từ repo GitHub K-Dense-AI/scientific-agent-skills vào ~/.claude/skills/glycoengineering/ của mình. Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.
Cài bằng lệnh thủ công
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/glycoengineering ~/.claude/skills/⚠ Đây là skill do người khác tạo. Hãy kiểm tra repo gốc trước khi cài.
- Mở Terminal (macOS/Linux) hoặc WSL/Git Bash trên Windows.
- Tải repo skill:
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git - Tạo thư mục skill của Claude:
mkdir -p ~/.claude/skills - Copy skill cần dùng:
cp -r scientific-agent-skills/skills/glycoengineering ~/.claude/skills/ - Cài Python 3 và thư viện
requestsđể chạy ví dụ:pip install requests(nếu cần phân tích glycan shield:uv pip install glycoshield). - Khởi động lại Claude Code, rồi yêu cầu ví dụ: "Phân tích các site N-glycosylation của chuỗi protein này".
- Lưu ý: kết quả chỉ là dự đoán in-silico, cần xác nhận bằng khối phổ hoặc thực nghiệm.
Xem mã nguồn trên GitHub ↗Giấy phép: MIT