Claude Skill MartKhám phá skillCâu dùng ngayHọc qua videoDùng terminalSkill là gì?
 
← Về danh sách

Truy vấn đồ thị tri thức y sinh NCATS ARAX

Gửi truy vấn TRAPI có giới hạn (một bước hoặc hai bước ghim hai đầu) tới API ARAX của NCATS Translator để lấy quan hệ y sinh kèm nguồn gốc bằng chứng.

Dữ liệu · Phân tíchNâng cao★ 33,030⑂ 3,248Điểm AI 8/10Cập nhật lần cuối: 9 thg 8, 2026

Làm được gì

  • Gửi truy vấn TRAPI tới API sản xuất ARAX và lưu lại request.json, response.json, summary.json để tái lập.
  • Chuẩn hóa thực thể từ văn bản tự do sang CURIE (ví dụ "primary myelofibrosis") ở bước riêng, chỉ để xem xét, không tự động chạy truy vấn đồ thị.
  • Chỉ cho phép truy vấn một bước (gán kiểu cho cả hai nút, ghim ít nhất một đầu) và hai bước với cả hai đầu được ghim, tránh dò đường vô hạn.
  • Mặc định dùng RTX-KG2; chỉ liên kết nhiều nguồn (federated) khi người dùng nêu rõ từ 2 đến 5 nhà cung cấp.
  • Giữ nguyên predicate, qualifier, nguồn sơ cấp/tổng hợp và thông tin công bố; kết quả 0 được diễn giải là "không trả về theo ràng buộc này", không phải "không có quan hệ".
  • Cố ý loại bỏ suy luận, xếp hạng, dự đoán liên kết, Pathfinder, tư vấn lâm sàng.

Dành cho ai

  • Nhà nghiên cứu tin sinh học, y học chuyển dịch cần tra cứu quan hệ thuốc–gen–bệnh theo mô hình Biolink.
  • Người làm curation dữ liệu/tài liệu cần nhật ký truy vấn có thể tái lập và nguồn gốc rõ ràng.
  • Nhóm muốn hàng rào an toàn nghiêm ngặt để LLM không thổi phồng kết quả đồ thị tri thức.

Ví dụ sử dụng

  1. Quan hệ thuốc–gen: tra imatinib (CHEBI:31690) làm giảm hoạt tính ABL1 (NCBIGene:25) với qualifier hướng "decreased".
  2. Đường hai bước: ivacaftor (CHEBI:66901) → Gene → xơ nang (MONDO:0009061), ghim cả hai đầu.
  3. Xem lại kết quả đã lưu: dùng lệnh summarize ngoại tuyến để tóm tắt binding và nguồn gốc từ phản hồi cũ cho báo cáo.

· · · Hướng dẫn cài đặt · · ·

Dùng thử ngay, không cần cài

Dán đoạn dưới vào Claude là dùng được skill này mà không cần cài đặt.

Hãy đọc hướng dẫn trong tệp này và làm theo để giúp mình:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/ncats-arax/SKILL.md

Mình muốn: (viết việc bạn cần ở đây)

Nếu Claude không mở được liên kết, hãy mở liên kết và copy nội dung vào rồi dán.

↓ Thấy hữu ích thì tải ZIP bên dưới và cài. Sau đó skill tự chạy, không phải dán lại mỗi lần.

Cài vào ứng dụng Claude (không cần terminal)
  1. Tải tệp ZIP bằng nút bên dưới.
  2. Trong Claude, mở Settings → Capabilities và bật 'Code execution and file creation'. (chỉ một lần)
  3. Vào Customize → Skills → + → 'Upload a skill' rồi tải tệp ZIP lên.
↓ Tải ZIP
Cài vào Claude Code

Để Claude làm — dán câu dưới đây vào Claude Code

Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart.
Copy thư mục skills/ncats-arax từ repo GitHub K-Dense-AI/scientific-agent-skills vào ~/.claude/skills/ncats-arax/ của mình.
Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.

Cài bằng lệnh thủ công

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git /tmp/sas && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r /tmp/sas/skills/ncats-arax ~/.claude/skills/

⚠ Đây là skill do người khác tạo. Hãy kiểm tra repo gốc trước khi cài.

  1. Chuẩn bị: cần Python 3.10 trở lên và kết nối HTTPS tới arax.transltr.io. Không cần API key.
  2. Tải mã nguồn: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  3. Chép skill: mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/ncats-arax ~/.claude/skills/
  4. Kiểm tra: chạy python ~/.claude/skills/ncats-arax/scripts/arax_client.py preflight để xác nhận dịch vụ ARAX và phiên bản TRAPI hợp lệ.
  5. Khởi động lại Claude Code, rồi yêu cầu kiểu "dùng ARAX tra quan hệ giữa thuốc X và gen Y".
  6. Lưu ý: truy vấn có thể bị công khai — tuyệt đối không nhập dữ liệu bệnh nhân hoặc thông tin nghiên cứu bí mật.
Xem mã nguồn trên GitHub ↗Giấy phép: MIT