Claude Skill MartKhám phá skillCâu dùng ngayHọc qua videoDùng terminalSkill là gì?
 
← Về danh sách

Trợ lý LaminDB cho dữ liệu sinh học

Skill hướng dẫn Claude đăng ký, kiểm định, truy vấn dữ liệu sinh học và theo dõi lineage bằng LaminDB.

Dữ liệu · Phân tíchNâng cao★ 33,030⑂ 3,248Điểm AI 8/10Cập nhật lần cuối: 9 thg 8, 2026

Skill này làm được gì

Hỗ trợ toàn bộ công việc với LaminDB — lakehouse mã nguồn mở chú trọng lineage cho dữ liệu sinh học.

  • Quản lý artifact: đăng ký DataFrame/AnnData/Zarr/Parquet, versioning, collections
  • Theo dõi lineage: ln.track()/ln.finish(), @ln.flow()/@ln.step(), view_lineage()
  • Kiểm định & chuẩn hóa: dùng DataFrameCurator, AnnDataCurator, SpatialDataCurator theo schema
  • Chú giải ontology: chuẩn hóa gene, cell type, tissue, disease qua Bionty
  • Tích hợp & triển khai: Nextflow, Snakemake, W&B, MLflow, S3/GCS/PostgreSQL
  • Nguyên tắc bảo mật: chỉ kiểm tra sự tồn tại của biến môi trường, không in ra khóa bí mật

Phù hợp với ai

  • Nhà nghiên cứu tin sinh học làm việc với scRNA-seq, spatial, flow cytometry
  • Data engineer trong công ty dược/biotech cần tái lập và tuân thủ FAIR
  • Nhóm muốn nâng cấp instance LaminDB từ SQLite cục bộ lên PostgreSQL trên cloud

Ví dụ sử dụng

  1. "Chuẩn hóa cột cell_type trong file h5ad theo ontology CL rồi lưu thành artifact đã kiểm định"
  2. "Truy vấn các artifact có key bắt đầu bằng scrna/ với tissue=PBMC và condition=treated"
  3. "Viết đoạn code Nextflow lấy fastq đầu vào từ LaminDB và đăng ký counts.csv đầu ra"

· · · Hướng dẫn cài đặt · · ·

Dùng thử ngay, không cần cài

Dán đoạn dưới vào Claude là dùng được skill này mà không cần cài đặt.

Hãy đọc hướng dẫn trong tệp này và làm theo để giúp mình:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/lamindb/SKILL.md

Mình muốn: (viết việc bạn cần ở đây)

Nếu Claude không mở được liên kết, hãy mở liên kết và copy nội dung vào rồi dán.

↓ Thấy hữu ích thì tải ZIP bên dưới và cài. Sau đó skill tự chạy, không phải dán lại mỗi lần.

Cài vào ứng dụng Claude (không cần terminal)
  1. Tải tệp ZIP bằng nút bên dưới.
  2. Trong Claude, mở Settings → Capabilities và bật 'Code execution and file creation'. (chỉ một lần)
  3. Vào Customize → Skills → + → 'Upload a skill' rồi tải tệp ZIP lên.
↓ Tải ZIP
Cài vào Claude Code

Để Claude làm — dán câu dưới đây vào Claude Code

Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart.
Copy thư mục skills/lamindb từ repo GitHub K-Dense-AI/scientific-agent-skills vào ~/.claude/skills/lamindb/ của mình.
Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.

Cài bằng lệnh thủ công

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/lamindb ~/.claude/skills/

⚠ Đây là skill do người khác tạo. Hãy kiểm tra repo gốc trước khi cài.

  1. Mở terminal và clone repo: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  2. Tạo thư mục skills: mkdir -p ~/.claude/skills
  3. Copy skill: cp -r scientific-agent-skills/skills/lamindb ~/.claude/skills/
  4. Kiểm tra thư mục references/ đã có: ls ~/.claude/skills/lamindb
  5. Cài LaminDB: uv pip install 'lamindb==2.5.1' (nên kiểm tra bản mới nhất)
  6. Chạy lamin login, rồi lamin init --storage ./mydata để khởi tạo instance
  7. Khởi động lại Claude Code và thử yêu cầu: "Đăng ký artifact này vào LaminDB".
Xem mã nguồn trên GitHub ↗Giấy phép: MIT