Danh sách skill

Kỹ năng giúp tra cứu đồ thị tri thức PrimeKG liên kết gene, thuốc, bệnh và kiểu hình bằng Python.

Skill hướng dẫn thực hiện trọn quy trình phân tích biểu hiện gen khác biệt cho bulk RNA-seq bằng PyDESeq2: thiết kế công thức, kiểm định Wald, hiệu chỉnh FDR, co giãn LFC và trực quan hóa.

Kỹ năng giúp viết và chạy các workflow hóa tính toán trên nền tảng đám mây Rowan: dự đoán pKa, docking, tìm conformer/tautomer, cofolding protein–ligand.

Skill hỗ trợ dựng và huấn luyện mạch lượng tử bằng PennyLane với mã mẫu sẵn dùng.

Hướng dẫn dùng RDKit để phân tích phân tử: đọc SMILES/SDF, tính descriptor, fingerprint, tìm cấu trúc con và sinh tọa độ 2D/3D.

Viết và gỡ lỗi mã TorchDrug 0.2.1 cho dự đoán tính chất phân tử, sinh phân tử, tổng hợp nghịch, protein và đồ thị tri thức.

Skill nghiên cứu giúp dùng PathML 3.0.5 để tile ảnh WSI, xây pipeline tiền xử lý/QC, định lượng multiplex, tạo đồ thị không gian và lập kế hoạch suy luận cục bộ an toàn.

Kỹ năng hướng dẫn Claude dùng ETE 4 để đọc, chỉnh sửa, so sánh, chú giải và trực quan hóa cây phát sinh loài có sẵn.

Kiểm tra cấu hình, dữ liệu, chi phí và quyền riêng tư tại máy trước khi chạy HypoGeniC/HypoRefine để sinh giả thuyết từ dữ liệu văn bản có nhãn.

Skill phân biệt rõ PufferLib 3.0.0 và nhánh nguồn 4.0, hướng dẫn bọc môi trường, vector hóa, huấn luyện PuffeRL và kiểm tra checkpoint an toàn.

Skill sàng lọc thư viện hợp chất bằng quy tắc drug-likeness (Lipinski, Veber, CNS), cảnh báo cấu trúc PAINS/NIBR, chỉ số phức tạp và ngôn ngữ truy vấn medchem.

Kỹ năng giúp làm sạch, lọc, so sánh và tra cứu thư viện phổ MS/MS bằng matchms 0.33.1 với API mới nhất.

Bộ kỹ năng xử lý trọn vẹn bản ghi Neuropixels bằng SpikeInterface: nạp dữ liệu, tiền xử lý, hiệu chỉnh trôi, phân loại xung, tính chỉ số chất lượng và curation đơn vị.

Skill hướng dẫn cài đặt, cấu hình và mở rộng Pi — bộ khung coding agent tối giản trên terminal — thông qua bảng định tuyến tài liệu.

Skill hướng dẫn dùng Paperclip CLI để tìm và đọc toàn văn ~11 triệu bài báo y sinh, hồ sơ FDA/EMA/PMDA, thử nghiệm lâm sàng và cơ sở dữ liệu protein, kèm trích dẫn ghim theo số dòng.

Kỹ năng giúp xây dựng, chạy và giám sát các workload genomics trên DNAnexus bằng dx CLI và dxpy một cách an toàn, tái lập được.

Kỹ năng giúp chọn và đặt các quy trình thí nghiệm tự động trên Ginkgo Cloud Lab: biểu hiện & tinh sạch protein, tổng hợp IVT RNA, thermal shift, Echo-MS, SPR.

Skill chuyên dụng cho Geniml: xác thực file BED và hợp đồng universe, lập kế hoạch huấn luyện Region2Vec/scEmbed và kiểm tra tương thích model/tokenizer.

Kỹ năng giúp dùng gtars (Python/Rust/CLI) cho đại số tập hợp interval hệ gen, coverage, tokenizer và refget theo quy trình an toàn với phiên bản ghim chính xác.

Kỹ năng giúp truy vấn, tải về và trực quan hóa dữ liệu ảnh ung thư công khai từ NCI Imaging Data Commons mà không cần xác thực.