Trình khai thác dữ liệu ảnh ung thư IDC (NCI)
Kỹ năng giúp truy vấn, tải về và trực quan hóa dữ liệu ảnh ung thư công khai từ NCI Imaging Data Commons mà không cần xác thực.
Dữ liệu · Phân tíchTrung cấp★ 33,030⑂ 3,248Điểm AI 8/10Cập nhật lần cuối: 9 thg 8, 2026
Kỹ năng này làm gì
- Truy vấn dữ liệu ảnh công khai (CT, MR, PET, tiêu bản bệnh học) của NCI Imaging Data Commons — không cần đăng nhập.
- Tự chọn đường truy cập tối ưu: máy chủ MCP của IDC nếu phiên đã có, REST API qua
curlkhi chỉ cần metadata, hoặc gói Pythonidc-indexkhi cần tải file và phân tích bằng pandas. - Giải thích mô hình dữ liệu và các bảng chỉ mục (
index,collections_index,ct_index,seg_index...) cùng khóa joinSeriesInstanceUIDđể viết SQL chính xác. - Tải file DICOM, tạo URL xem ảnh trên trình duyệt (OHIF/SLIM), kiểm tra giấy phép (CC BY và CC BY-NC) và sinh trích dẫn.
- Cảnh báo các lỗi thường gặp, ví dụ thứ tự tham số ngược nhau giữa
download_from_selectionvàdownload_dicom_series.
Phù hợp với ai
- Nhà nghiên cứu, học viên cao học xây dựng tập dữ liệu huấn luyện AI y tế.
- Bác sĩ/nghiên cứu viên cần chọn lọc cohort ảnh X quang hoặc bệnh học số.
- Người cần xác minh giấy phép và trích dẫn trước khi dùng dữ liệu cho bài báo hoặc sản phẩm thương mại.
Ví dụ sử dụng
- "Liệt kê 20 chuỗi ảnh MR của ung thư vú" → sinh câu SQL join
collections_indexvớiindex. - "Tải 5 chuỗi CT ngực từ bộ nlst về thư mục ./data" → lấy SeriesInstanceUID rồi gọi
download_from_selection. - "Cohort này dùng cho sản phẩm thương mại được không?" → thống kê
license_short_nameđể phát hiện CC BY-NC và tạo trích dẫn kèm theo.
· · · Hướng dẫn cài đặt · · ·
Dùng thử ngay, không cần cài
Dán đoạn dưới vào Claude là dùng được skill này mà không cần cài đặt.
Hãy đọc hướng dẫn trong tệp này và làm theo để giúp mình: https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/imaging-data-commons/SKILL.md Mình muốn: (viết việc bạn cần ở đây)
Nếu Claude không mở được liên kết, hãy mở liên kết và copy nội dung vào rồi dán.
↓ Thấy hữu ích thì tải ZIP bên dưới và cài. Sau đó skill tự chạy, không phải dán lại mỗi lần.
Cài vào ứng dụng Claude (không cần terminal)
- Tải tệp ZIP bằng nút bên dưới.
- Trong Claude, mở Settings → Capabilities và bật 'Code execution and file creation'. (chỉ một lần)
- Vào Customize → Skills → + → 'Upload a skill' rồi tải tệp ZIP lên.
Cài vào Claude Code
Để Claude làm — dán câu dưới đây vào Claude Code
Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart. Copy thư mục skills/imaging-data-commons từ repo GitHub K-Dense-AI/scientific-agent-skills vào ~/.claude/skills/imaging-data-commons/ của mình. Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.
Cài bằng lệnh thủ công
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/imaging-data-commons ~/.claude/skills/⚠ Đây là skill do người khác tạo. Hãy kiểm tra repo gốc trước khi cài.
- Mở Terminal.
- Tải mã nguồn:
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git - Tạo thư mục kỹ năng:
mkdir -p ~/.claude/skills - Sao chép kỹ năng:
cp -r scientific-agent-skills/skills/imaging-data-commons ~/.claude/skills/ - Khởi động lại Claude Code và thử hỏi: "Tìm dữ liệu CT ung thư phổi trên IDC".
- (Tùy chọn) Nếu cần tải ảnh hoặc phân tích bằng pandas, cài trong môi trường ảo:
pip install idc-index. Nếu chỉ hỏi metadata thì không cần cài gì, kỹ năng sẽ dùng REST API.
Xem mã nguồn trên GitHub ↗Giấy phép: MIT