Trợ lý workflow TorchDrug

Skill này làm gì

Hướng dẫn tạo code TorchDrug 0.2.1 theo cấu trúc 4 bước datasets → models → tasks → core.Engine một cách chính xác.

• Kiểm tra phiên bản trước: Python 3.7–3.10, PyTorch 1.8–2.0; Apple Silicon chỉ chạy CPU, không hỗ trợ MPS.
• Cài đặt đúng cách: chọn wheel torch-scatter / torch-cluster khớp chính xác với cặp PyTorch + CUDA.
• Mẫu chuẩn cho từng bài toán: dự đoán tính chất phân tử (GIN + PropertyPrediction), pretrain tự giám sát (InfoGraph, AttributeMasking), sinh phân tử (GCPN, GraphAF), retrosynthesis, suy luận knowledge graph (RotatE, NeuralLP), mô hình protein (ESM, GearNet).
• Gỡ lỗi: lệch số chiều đặc trưng, lệch thiết bị (CPU/GPU), lỗi nạp checkpoint.

Phù hợp với ai

• Nghiên cứu sinh, nhà nghiên cứu dùng graph neural network trong phát triển thuốc / tin-hóa học
• Lập trình viên bị chặn ở bước cài đặt hoặc lỗi API khi chạy ví dụ TorchDrug
• Người từng mất thời gian vì LLM bịa ra API TorchDrug không tồn tại

Ví dụ sử dụng

1. "Huấn luyện mô hình dự đoán độc tính trên tập ClinTox" → sinh script đầy đủ với GIN, tasks.PropertyPrediction và core.Engine.
2. "Tôi bị lỗi import torch-scatter" → kiểm tra Python/PyTorch/wheel như một bộ tương thích và đưa lệnh cài lại.
3. "Xây pipeline retrosynthesis với USPTO50k" → tạo hai view dataset cùng seed, huấn luyện riêng hai task rồi ghép bằng tasks.Retrosynthesis.

Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart.
Copy thư mục skills/torchdrug từ repo GitHub K-Dense-AI/scientific-agent-skills vào ~/.claude/skills/torchdrug/ của mình.
Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.