Truy vấn đồ thị tri thức y học chính xác PrimeKG
Kỹ năng giúp tra cứu đồ thị tri thức PrimeKG liên kết gene, thuốc, bệnh và kiểu hình bằng Python.
Dữ liệu · Phân tíchTrung cấp★ 33,030⑂ 3,248Điểm AI 8/10Cập nhật lần cuối: 9 thg 8, 2026
Kỹ năng này làm gì
Cho phép Claude truy vấn PrimeKG – đồ thị tri thức y học chính xác của Harvard với ~129.000 node, ~4 triệu cạnh và 29 loại quan hệ.
search_nodes(): tìm node gene, protein, thuốc, bệnh, kiểu hìnhget_neighbors(): lấy toàn bộ liên kết trực tiếp, có bộ lọc theo loại quan hệget_disease_context(): tóm tắt nhanh gene, thuốc và kiểu hình liên quan tới một bệnh- Giải thích các loại quan hệ chính:
drug_protein,disease_gene,disease_phenotype,gwas...
Phù hợp với ai
- Nhà nghiên cứu tìm đích tác dụng thuốc mới hoặc cơ hội tái định vị thuốc
- Chuyên viên phân tích dữ liệu y sinh cần nối triệu chứng với bệnh và gene
- Học viên cao học, phòng lab làm về dược lý mạng lưới và sinh học đa thang bậc
Ví dụ sử dụng
- "Tổng hợp gene và thuốc liên quan tới bệnh Alzheimer" → chạy
get_disease_context("Alzheimer's disease") - "Chỉ liệt kê protein đích của một loại thuốc" →
get_neighbors(drug_id, relation_type="drug_protein") - "Tìm bệnh khác có kiểu hình trùng lặp" → lần theo node kiểu hình để gợi ý hướng tái định vị thuốc
· · · Hướng dẫn cài đặt · · ·
Dùng thử ngay, không cần cài
Dán đoạn dưới vào Claude là dùng được skill này mà không cần cài đặt.
Hãy đọc hướng dẫn trong tệp này và làm theo để giúp mình: https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/primekg/SKILL.md Mình muốn: (viết việc bạn cần ở đây)
Nếu Claude không mở được liên kết, hãy mở liên kết và copy nội dung vào rồi dán.
↓ Thấy hữu ích thì tải ZIP bên dưới và cài. Sau đó skill tự chạy, không phải dán lại mỗi lần.
Cài vào ứng dụng Claude (không cần terminal)
- Tải tệp ZIP bằng nút bên dưới.
- Trong Claude, mở Settings → Capabilities và bật 'Code execution and file creation'. (chỉ một lần)
- Vào Customize → Skills → + → 'Upload a skill' rồi tải tệp ZIP lên.
Cài vào Claude Code
Để Claude làm — dán câu dưới đây vào Claude Code
Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart. Copy thư mục skills/primekg từ repo GitHub K-Dense-AI/scientific-agent-skills vào ~/.claude/skills/primekg/ của mình. Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.
Cài bằng lệnh thủ công
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/primekg ~/.claude/skills/⚠ Đây là skill do người khác tạo. Hãy kiểm tra repo gốc trước khi cài.
- Mở terminal và tải kho mã:
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git - Sao chép thư mục kỹ năng:
mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/primekg ~/.claude/skills/ - Cài thư viện cần thiết:
pip install pandas - Tải tệp
kg.csvtừ PrimeKG Harvard Dataverse (tệp rất lớn, hãy chuẩn bị dung lượng ổ đĩa). - Trỏ biến môi trường tới tệp dữ liệu:
export PRIMEKG_DATA=/duong/dan/kg.csv(bỏ qua đường dẫn WindowsC:\Users\eamon\...còn sót trong tài liệu). - Khởi động lại Claude Code và thử yêu cầu: "Dùng PrimeKG tìm gene liên quan tới Alzheimer".
Xem mã nguồn trên GitHub ↗Giấy phép: MIT