PrimeKG – Đồ thị tri thức y học chính xác
Cho phép Claude truy vấn đồ thị tri thức PrimeKG liên kết gene, thuốc, bệnh và kiểu hình.
Dữ liệu · Phân tíchTrung cấp★ 33,030⑂ 3,248Điểm AI 6/10Cập nhật lần cuối: 9 thg 8, 2026
Kỹ năng này làm gì
Kết nối Claude Code với PrimeKG (đồ thị tri thức y học chính xác của Harvard: ~129.000 node, 4 triệu quan hệ, 29 loại liên kết) thông qua script Python.
search_nodes: tìm ID của gene, protein, thuốc, bệnh, kiểu hình theo tênget_neighbors: lấy toàn bộ quan hệ trực tiếp (drug-target, disease-gene, GWAS...)get_disease_context: tổng hợp nhanh gene, thuốc và kiểu hình liên quan tới một bệnh- Lọc theo
relation_typeđể chỉ xem loại bằng chứng cần thiết
Phù hợp với ai
- Nhà nghiên cứu phát triển thuốc muốn tìm đích tác dụng hoặc cơ hội tái định hướng thuốc
- Chuyên gia tin sinh học, lâm sàng cần liên hệ triệu chứng – bệnh – gene
- Học viên cao học, nhà phân tích dữ liệu làm dược lý mạng (network pharmacology)
Ví dụ sử dụng
- "Tổng hợp gene và thuốc liên quan đến bệnh Alzheimer từ PrimeKG" → gọi
get_disease_contextrồi trình bày dạng bảng - "Liệt kê protein đích của metformin và các bệnh khác liên quan tới những protein đó" → lọc quan hệ
drug_proteinvà mở rộng 2 bước để tìm ứng viên tái định hướng - "Từ danh sách kiểu hình này, gợi ý bệnh hiếm khớp nhất" → phân tích trùng lặp dựa trên quan hệ
disease_phenotype
· · · Hướng dẫn cài đặt · · ·
Cài vào ứng dụng Claude (không cần terminal)
- Tải tệp ZIP bằng nút bên dưới.
- Trong Claude, mở Settings → Capabilities và bật 'Code execution and file creation'. (chỉ một lần)
- Vào Customize → Skills → + → 'Upload a skill' rồi tải tệp ZIP lên.
Cài vào Claude Code
Để Claude làm — dán câu dưới đây vào Claude Code
Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart. Copy thư mục skills/primekg từ repo GitHub K-Dense-AI/scientific-agent-skills vào ~/.claude/skills/primekg/ của mình. Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.
Cài bằng lệnh thủ công
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/primekg ~/.claude/skills/⚠ Đây là skill do người khác tạo. Hãy kiểm tra repo gốc trước khi cài.
- Mở terminal và clone repo:
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git - Chép kỹ năng vào thư mục Claude:
mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/primekg ~/.claude/skills/ - Cài thư viện cần thiết:
pip install pandas - Tải file
kg.csvtừ PrimeKG Harvard Dataverse (file rất lớn, hãy chuẩn bị dung lượng đĩa) - Trỏ script tới dữ liệu:
export PRIMEKG_DATA=/duong/dan/kg.csv(bỏ qua đường dẫn Windows còn sót trong tài liệu) - Khởi động lại Claude Code và thử yêu cầu: "Tìm gene liên quan Alzheimer trong PrimeKG".
Xem mã nguồn trên GitHub ↗Giấy phép: MIT