Danh sách skill
Trợ lý tối ưu đa mục tiêu pymoo
Skill hướng dẫn dùng pymoo để định nghĩa bài toán tối ưu một/đa/nhiều mục tiêu, tìm mặt Pareto và chọn giải pháp cuối cùng.
Truy vấn dữ liệu CELLxGENE Census
Kỹ năng hướng dẫn Claude truy vấn và phân tích dữ liệu single-cell/spatial công khai quy mô hơn 200 triệu tế bào từ CZ CELLxGENE Census mà không cần tải toàn bộ dataset.
Kiểm tra tài liệu kế hoạch điều trị
Định dạng và kiểm tra cấu trúc tài liệu kế hoạch điều trị đã được bác sĩ có giấy phép quyết định và xác minh, hoàn toàn chạy cục bộ.
Đánh giá mức độ nghiêm trọng RELSA & dự báo điểm kết thúc nhân đạo
Gộp cân nặng, thân nhiệt, điểm lâm sàng và dấu ấn sinh học của động vật thí nghiệm thành một điểm RELSA duy nhất và dùng ARIMA để dự báo thời điểm đạt điểm kết thúc nhân đạo.
Kỹ năng ESM cho mô hình ngôn ngữ protein
Hướng dẫn dùng SDK `esm` với ESM3, ESM C, ESMFold2 và API Forge/Biohub để sinh chuỗi, dự đoán cấu trúc và trích xuất embedding protein.
Tích hợp LatchBio (workflow tin sinh học)
Skill hướng dẫn Claude viết, đăng ký, gỡ lỗi và chạy workflow tin sinh học trên nền tảng Latch bằng Python SDK, Nextflow và Snakemake.
Quy trình PyTDC (Therapeutics Data Commons)
Skill giúp dùng PyTDC 1.1.15 để khám phá dataset, chia tập, tính metric, chạy benchmark group và oracle phân tử một cách có kiểm soát và cần phê duyệt trước khi tải.
API thiết kế phân tử trên đám mây Tamarind Bio
Giúp chạy các công cụ sinh học cấu trúc mã nguồn mở (AlphaFold, Boltz, RFdiffusion…) trên đám mây Tamarind Bio qua REST hoặc MCP, không cần GPU tại máy.
QuTiP 5 — Mô phỏng động lực học lượng tử
Kỹ năng hướng dẫn mô phỏng và kiểm định hệ lượng tử kín/mở bằng QuTiP 5.3, với đơn vị, chiều Hilbert và hội tụ số được nêu rõ.
Phân tích RNA velocity với scVelo
Skill hướng dẫn Claude thực hiện toàn bộ quy trình RNA velocity bằng scVelo: suy luận hướng chuyển trạng thái tế bào, latent time và gene điều khiển từ dữ liệu scRNA-seq.
Tích hợp LabArchives
Kỹ năng hướng dẫn tích hợp an toàn với API ELN và Inventory v1 của LabArchives: ký HMAC, chọn endpoint theo khu vực và tuân thủ quy tắc bảo mật.
Trợ lý LaminDB cho dữ liệu sinh học
Skill hướng dẫn Claude đăng ký, kiểm định, truy vấn dữ liệu sinh học và theo dõi lineage bằng LaminDB.
Quy trình phân tích tín hiệu sinh lý với NeuroKit2
Skill nghiên cứu giúp tiền xử lý và phân tích ECG, EDA, RSP bằng NeuroKit2 0.2.13 theo cách tái lập được.
OneKGPd — Truy vấn cấp cá thể trên 1000 Genomes
Skill Claude giúp truy vấn bộ dữ liệu 1000 Genomes (3.202 mẫu giải trình tự toàn hệ gen, GRCh38) ở mức từng cá thể và từng biến thể.
Tối ưu hóa GPU cho Python (NVIDIA)
Chuyển mã Python khoa học chậm chạp sang GPU NVIDIA và kiểm chứng rằng kết quả vẫn đúng và thực sự nhanh hơn.
Phân tích trường vận tốc PIV với OpenPIV
Trích xuất trường vận tốc từ cặp ảnh PIV, kiểm định vector và tính xoáy, biến dạng, thống kê rối.
Trợ lý chạy pacsomatic
Kỹ năng kiểm tra đầu vào, tạo samplesheet/params và chạy hoặc submit pipeline nf-core/pacsomatic (phân tích tumor-normal từ BAM) lên máy cục bộ hoặc cụm HPC.
Phân tích biểu hiện gen khác biệt với PyDESeq2
Skill hướng dẫn thực hiện trọn quy trình phân tích biểu hiện gen khác biệt cho bulk RNA-seq bằng PyDESeq2: thiết kế công thức, kiểm định Wald, hiệu chỉnh FDR, co giãn LFC và trực quan hóa.