Skill chạy sẵn giúp xử lý, định lượng và chú giải dữ liệu LC-MS/MS proteomics và metabolomics bằng pyOpenMS.
Gộp cân nặng, thân nhiệt, điểm lâm sàng và dấu ấn sinh học thành một điểm RELSA duy nhất, rồi dùng ARIMA dự báo trước thời điểm đạt endpoint nhân đạo.
Kỹ năng sàng lọc thư viện hợp chất bằng các quy tắc hóa dược (Lipinski, PAINS, NIBR) và ngôn ngữ truy vấn medchem.
Mô phỏng hệ lượng tử kín và mở bằng QuTiP 5.3, đồng thời kiểm toán giả định vật lý và hội tụ số.
Skill chuyên dụng cho Geniml: kiểm định BED/universe, lập kế hoạch huấn luyện Region2Vec, scEmbed và xây dựng consensus universe một cách an toàn.
Kỹ năng phân tích, kiểm định, chuyển đổi cấu trúc vật liệu và dữ liệu tính toán bằng pymatgen theo hướng tái lập được.
Kỹ năng giúp Claude Code dùng COBRApy để chạy FBA, FVA, knockout gene và lấy mẫu flux trên các mô hình trao đổi chất quy mô genome.
Phân tích dữ liệu ghi ngoại bào Neuropixels từ đầu đến cuối bằng SpikeInterface: nạp dữ liệu, tiền xử lý, sorting, chỉ số chất lượng và curation.
Kỹ năng chạy trọn quy trình scVelo để suy luận hướng chuyển trạng thái tế bào và latent time từ động học splicing trong dữ liệu single-cell RNA-seq.
Giúp Claude thực hiện phân tích tin sinh học bằng scikit-bio: chuỗi, gióng hàng, cây phát sinh loài, chỉ số đa dạng, PCoA và PERMANOVA.
Skill chuyên sâu giúp xây dựng, kiểm thử và phân tích mô phỏng sự kiện rời rạc có giới hạn bằng SimPy.
Skill điều phối toàn bộ quy trình bulk RNA-seq: từ FASTQ thô qua QC, định lượng, biểu hiện khác biệt, pathway đến hình cho bài báo.
Skill giúp tổ chức, truy vấn, kiểm tra và chuyển đổi dữ liệu thần kinh (MRI, EEG, PET...) theo chuẩn BIDS.
Skill hướng dẫn dùng các mô hình sinh sâu (scVI, totalVI, MultiVI...) để hiệu chỉnh batch, tích hợp đa mô thức và phân tích biểu hiện khác biệt trên dữ liệu single-cell.
Truy vấn, xuất metadata và lập kế hoạch chuyển dữ liệu hiển vi trên OMERO.server một cách an toàn bằng omero-py và BlitzGateway.
Kỹ năng giúp lưu trữ dữ liệu VCF/BCF vào mảng thưa TileDB rồi truy vấn, xuất dữ liệu theo mẫu và vùng gen một cách hiệu quả.
Kỹ năng quét vị trí N-/O-glycosylation trên chuỗi protein và hỗ trợ thiết kế glycan cho kháng thể trị liệu, kháng nguyên vaccine.
Kỹ năng giúp khám phá và sử dụng an toàn dataset, cách chia tập, metric, benchmark và oracle của Therapeutics Data Commons qua gói PyTDC.
Skill truy vấn dữ liệu DepMap về điểm phụ thuộc gen CRISPR và độ nhạy thuốc để tìm điểm yếu đặc hiệu của tế bào ung thư.
Skill hướng dẫn Claude suy luận mối quan hệ yếu tố phiên mã – gene đích từ dữ liệu biểu hiện bằng GRNBoost2/GENIE3.