Dữ liệu · Phân tích
QuTiP 5 — Mô phỏng động lực học lượng tử
Kỹ năng hướng dẫn mô phỏng và kiểm định hệ lượng tử kín/mở bằng QuTiP 5.3, với đơn vị, chiều Hilbert và hội tụ số được nêu rõ.
Phân tích RNA velocity với scVelo
Skill hướng dẫn Claude thực hiện toàn bộ quy trình RNA velocity bằng scVelo: suy luận hướng chuyển trạng thái tế bào, latent time và gene điều khiển từ dữ liệu scRNA-seq.
DeepSpot-M Phiên mã không gian ảo
Skill hướng dẫn dùng DeepSpot-M để dự đoán biểu hiện gen không gian (~19k gen mã hóa protein) từ các tile ảnh mô học H&E.
Quy trình phân tích tín hiệu sinh lý với NeuroKit2
Skill nghiên cứu giúp tiền xử lý và phân tích ECG, EDA, RSP bằng NeuroKit2 0.2.13 theo cách tái lập được.
OneKGPd — Truy vấn cấp cá thể trên 1000 Genomes
Skill Claude giúp truy vấn bộ dữ liệu 1000 Genomes (3.202 mẫu giải trình tự toàn hệ gen, GRCh38) ở mức từng cá thể và từng biến thể.
Phân tích trường vận tốc PIV với OpenPIV
Trích xuất trường vận tốc từ cặp ảnh PIV, kiểm định vector và tính xoáy, biến dạng, thống kê rối.
Phân tích biểu hiện gen khác biệt với PyDESeq2
Skill hướng dẫn thực hiện trọn quy trình phân tích biểu hiện gen khác biệt cho bulk RNA-seq bằng PyDESeq2: thiết kế công thức, kiểm định Wald, hiệu chỉnh FDR, co giãn LFC và trực quan hóa.
Quy trình mô hình hóa phân tử Rowan
Kỹ năng giúp viết và chạy các workflow hóa tính toán trên nền tảng đám mây Rowan: dự đoán pKa, docking, tìm conformer/tautomer, cofolding protein–ligand.
PennyLane – Học máy lượng tử
Skill hỗ trợ dựng và huấn luyện mạch lượng tử bằng PennyLane với mã mẫu sẵn dùng.
TileDB-VCF quản lý dữ liệu biến thể gen
Kỹ năng hướng dẫn lưu trữ, nạp, truy vấn và xuất dữ liệu biến thể VCF/BCF trên mảng thưa TileDB cho di truyền quần thể.
Quy trình bệnh học tính toán PathML
Skill nghiên cứu giúp dùng PathML 3.0.5 để tile ảnh WSI, xây pipeline tiền xử lý/QC, định lượng multiplex, tạo đồ thị không gian và lập kế hoạch suy luận cục bộ an toàn.
Phân tích cây phát sinh loài với ETE Toolkit 4
Kỹ năng hướng dẫn Claude dùng ETE 4 để đọc, chỉnh sửa, so sánh, chú giải và trực quan hóa cây phát sinh loài có sẵn.
Trợ lý lập kế hoạch & kiểm toán HypoGeniC
Kiểm tra cấu hình, dữ liệu, chi phí và quyền riêng tư tại máy trước khi chạy HypoGeniC/HypoRefine để sinh giả thuyết từ dữ liệu văn bản có nhãn.
Lọc hợp chất với Medchem
Skill sàng lọc thư viện hợp chất bằng quy tắc drug-likeness (Lipinski, Veber, CNS), cảnh báo cấu trúc PAINS/NIBR, chỉ số phức tạp và ngôn ngữ truy vấn medchem.
Xử lý phổ khối matchms
Kỹ năng giúp làm sạch, lọc, so sánh và tra cứu thư viện phổ MS/MS bằng matchms 0.33.1 với API mới nhất.
Tích hợp OMERO (dữ liệu kính hiển vi)
Kỹ năng giúp truy vấn, xuất metadata và lập kế hoạch nhập/xuất dữ liệu ảnh kính hiển vi trên OMERO.server theo các quy tắc phạm vi và bảo mật nghiêm ngặt.
Di trú bảng PostgreSQL sang Hypertable (TimescaleDB)
Hướng dẫn từng bước chuyển bảng PostgreSQL hiện có thành hypertable của TimescaleDB, kèm cấu hình nén và truy vấn kiểm chứng hiệu năng.
Phân tích tác động biến thể với AlphaGenome
Kỹ năng tra cứu, tính điểm và diễn giải tác động điều hoà/splicing của SNV bằng mô hình AlphaGenome của DeepMind và AlphaGenome Atlas.