Claude Skill MartKhám phá skillCâu dùng ngayHọc qua videoDùng terminalSkill là gì?
 
← Về danh sách

Phân tích DepMap (bản đồ phụ thuộc ung thư)

Skill giúp truy vấn và phân tích dữ liệu phụ thuộc gen CRISPR và độ nhạy thuốc của DepMap để xác thực đích điều trị ung thư.

Dữ liệu · Phân tíchNâng cao★ 33,030⑂ 3,248Điểm AI 7/10Cập nhật lần cuối: 9 thg 8, 2026

Làm được gì

  • Hướng dẫn Claude sử dụng dữ liệu DepMap của Broad Institute: điểm gene effect CRISPR (Chronos), RNAi (DEMETER2), độ nhạy hợp chất PRISM.
  • Giải thích ngưỡng diễn giải điểm phụ thuộc (Chronos ≤ −0.5 là phụ thuộc, ≤ −1 là phụ thuộc mạnh) và các trường metadata dòng tế bào.
  • Cung cấp code Python để tìm phụ thuộc chọn lọc, kiểm định biomarker đột biến ↔ phụ thuộc (Mann–Whitney), và phân tích co-essentiality.
  • Kèm 3 quy trình: xác thực đích theo loại ung thư, sàng lọc synthetic lethality, phân tích độ nhạy hợp chất; cùng danh sách file dữ liệu chính.

Phù hợp với ai

  • Nhà nghiên cứu phát triển thuốc ung thư cần xác thực đích tác động.
  • Chuyên viên tin sinh học xử lý dữ liệu genomics/functional genomics ung thư.
  • Học viên cao học cần phân biệt gen thiết yếu toàn phổ và phụ thuộc chọn lọc theo ung thư.

Ví dụ sử dụng

  1. "Gen này có thiết yếu ở dòng tế bào phổi mang đột biến KRAS không?" → lọc dòng tế bào và so sánh gene effect.
  2. "Tìm đối tác synthetic lethal của BRCA1" → so sánh nhóm đột biến vs hoang dã, hiệu chỉnh FDR.
  3. "Liệt kê 20 gen có profile phụ thuộc tương quan nhất với gen X" → suy luận phức hệ/đường tín hiệu qua co-essentiality.

· · · Hướng dẫn cài đặt · · ·

Dùng thử ngay, không cần cài

Dán đoạn dưới vào Claude là dùng được skill này mà không cần cài đặt.

Hãy đọc hướng dẫn trong tệp này và làm theo để giúp mình:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/depmap/SKILL.md

Mình muốn: (viết việc bạn cần ở đây)

Nếu Claude không mở được liên kết, hãy mở liên kết và copy nội dung vào rồi dán.

↓ Thấy hữu ích thì tải ZIP bên dưới và cài. Sau đó skill tự chạy, không phải dán lại mỗi lần.

Cài vào ứng dụng Claude (không cần terminal)
  1. Tải tệp ZIP bằng nút bên dưới.
  2. Trong Claude, mở Settings → Capabilities và bật 'Code execution and file creation'. (chỉ một lần)
  3. Vào Customize → Skills → + → 'Upload a skill' rồi tải tệp ZIP lên.
↓ Tải ZIP
Cài vào Claude Code

Để Claude làm — dán câu dưới đây vào Claude Code

Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart.
Copy thư mục skills/depmap từ repo GitHub K-Dense-AI/scientific-agent-skills vào ~/.claude/skills/depmap/ của mình.
Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.

Cài bằng lệnh thủ công

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/depmap ~/.claude/skills/

⚠ Đây là skill do người khác tạo. Hãy kiểm tra repo gốc trước khi cài.

  1. Mở terminal.
  2. Tải repo: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  3. Tạo thư mục skill: mkdir -p ~/.claude/skills
  4. Copy skill: cp -r scientific-agent-skills/skills/depmap ~/.claude/skills/
  5. Cài thư viện Python: pip install pandas numpy scipy requests
  6. Tải các file dữ liệu (CRISPRGeneEffect.csv, sample_info.csv, ...) tại https://depmap.org/portal/download/all/ vào thư mục làm việc.
  7. Khởi động lại Claude Code và yêu cầu ví dụ: "Dùng DepMap phân tích mức phụ thuộc của gen EGFR theo loại ung thư".
Xem mã nguồn trên GitHub ↗Giấy phép: MIT