Claude Skill MartKhám phá skillCâu dùng ngayHọc qua videoDùng terminalSkill là gì?
 
← Về danh sách

Trợ lý phân tích tin sinh học scikit-bio

Kỹ năng giúp Claude viết code scikit-bio đúng API mới nhất cho phân tích chuỗi, gióng hàng, cây phát sinh loài và đa dạng hệ vi sinh.

Dữ liệu · Phân tíchTrung cấp★ 33,030⑂ 3,248Điểm AI 9/10Cập nhật lần cuối: 9 thg 8, 2026

Kỹ năng này làm gì

  • Đọc/ghi chuỗi DNA, RNA, protein ở nhiều định dạng (FASTA, FASTQ, GenBank, EMBL) và thao tác bổ sung nghịch, phiên mã, dịch mã, tìm motif.
  • Gióng hàng cặp/đa chuỗi bằng pair_align, pair_align_nucl, pair_align_prot với ma trận thay thế và gap affine, xử lý CIGAR và TabularMSA.
  • Dựng và phân tích cây phát sinh loài (NJ, UPGMA, GME, BME, NNI), tính khoảng cách patristic và Robinson-Foulds.
  • Tính đa dạng alpha/beta (Shannon, Chao1, Faith's PD, UniFrac), ordination (PCoA, CA, CCA, RDA) và kiểm định PERMANOVA, ANOSIM, PERMDISP, Mantel, phong phú vi sai.
  • Làm việc với bảng BIOM, pandas/polars/AnnData qua hệ thống dispatch và embedding protein từ mô hình ngôn ngữ.

Phù hợp với ai

  • Nhà nghiên cứu, học viên cao học phân tích dữ liệu hệ vi sinh và sinh thái quần xã.
  • Người dùng QIIME 2 muốn phân tích tiếp bằng Python.
  • Lập trình viên tin sinh cần dựng nhanh pipeline xử lý chuỗi và phát sinh loài.

Ví dụ sử dụng

  1. "Từ table.biom và tree.nwk hãy tính UniFrac không trọng số, chạy PCoA và vẽ theo cột bodysite."
  2. "Kiểm định PERMANOVA 999 lần hoán vị giữa hai nhóm và chạy kèm PERMDISP để kiểm tra phân tán."
  3. "Chuyển FASTQ sang FASTA theo kiểu tiết kiệm bộ nhớ rồi tìm vị trí motif ATG."

· · · Hướng dẫn cài đặt · · ·

Dùng thử ngay, không cần cài

Dán đoạn dưới vào Claude là dùng được skill này mà không cần cài đặt.

Hãy đọc hướng dẫn trong tệp này và làm theo để giúp mình:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/scikit-bio/SKILL.md

Mình muốn: (viết việc bạn cần ở đây)

Nếu Claude không mở được liên kết, hãy mở liên kết và copy nội dung vào rồi dán.

↓ Thấy hữu ích thì tải ZIP bên dưới và cài. Sau đó skill tự chạy, không phải dán lại mỗi lần.

Cài vào ứng dụng Claude (không cần terminal)
  1. Tải tệp ZIP bằng nút bên dưới.
  2. Trong Claude, mở Settings → Capabilities và bật 'Code execution and file creation'. (chỉ một lần)
  3. Vào Customize → Skills → + → 'Upload a skill' rồi tải tệp ZIP lên.
↓ Tải ZIP
Cài vào Claude Code

Để Claude làm — dán câu dưới đây vào Claude Code

Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart.
Copy thư mục skills/scikit-bio từ repo GitHub K-Dense-AI/scientific-agent-skills vào ~/.claude/skills/scikit-bio/ của mình.
Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.

Cài bằng lệnh thủ công

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/scikit-bio ~/.claude/skills/

⚠ Đây là skill do người khác tạo. Hãy kiểm tra repo gốc trước khi cài.

  1. Mở terminal và clone repo: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  2. Tạo thư mục kỹ năng: mkdir -p ~/.claude/skills
  3. Sao chép kỹ năng: cp -r scientific-agent-skills/skills/scikit-bio ~/.claude/skills/
  4. Cài thư viện: uv pip install scikit-bio (hoặc conda install -c conda-forge scikit-bio). Yêu cầu Python 3.10+ và NumPy 2.0+.
  5. Tùy chọn: uv pip install matplotlib seaborn plotly biom-format polars anndata để vẽ hình và đọc bảng BIOM.
  6. Khởi động lại Claude Code, rồi yêu cầu ví dụ: "Dùng scikit-bio phân tích beta diversity cho bảng OTU của tôi".
Xem mã nguồn trên GitHub ↗Giấy phép: MIT