클로드스킬마트스킬 둘러보기바로 쓰는 문장영상으로 배우기터미널 사용법스킬이 뭐예요?
 
← 목록으로

scikit-bio 생물정보 분석 도우미

Claude가 scikit-bio로 서열 분석, 정렬, 계통수, 마이크로바이옴 다양성·통계 분석 코드를 최신 API에 맞게 작성하도록 돕는 스킬입니다.

데이터·분석중급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 9/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

  • DNA/RNA/단백질 서열 읽기·쓰기(FASTA, FASTQ, GenBank 등)와 역상보·전사·번역, 모티프 검색 코드를 생성합니다.
  • scikit-bio 0.7의 pair_align 계열 함수로 전역/지역/반전역 정렬을 수행하고 CIGAR·TabularMSA로 결과를 다룹니다.
  • NJ/UPGMA/GME/BME 계통수 구축, Robinson-Foulds 비교, patristic 거리 계산을 안내합니다.
  • 알파/베타 다양성(Shannon, Faith's PD, UniFrac 등), PCoA·CCA·RDA 서열화, PERMANOVA·ANOSIM·Mantel·차등 풍부도 검정을 처리합니다.
  • BIOM 테이블, pandas/polars/AnnData 입력을 그대로 받는 dispatch 시스템과 단백질 임베딩 활용법까지 포함합니다.

이런 분께 추천

  • 마이크로바이옴·군집생태 데이터를 분석하는 연구자, 대학원생
  • QIIME 2 산출물(BIOM, 트리, 거리행렬)을 파이썬으로 후속 분석하려는 분
  • 서열 처리·계통 분석 파이프라인을 빠르게 프로토타이핑하려는 생물정보 개발자

활용 예시

  1. "table.biom과 tree.nwk로 unweighted UniFrac 거리 계산하고 PCoA 그려서 bodysite별로 색칠해줘" → 다양성 → 서열화 → 시각화 코드 생성.
  2. "두 그룹 간 군집 차이가 유의한지 PERMANOVA로 검정하고 PERMDISP도 같이 돌려줘" → 순열 999회 기준 검정 코드와 해석 주의점 안내.
  3. "FASTQ를 품질 필터링해 FASTA로 변환하고 ATG 모티프 위치를 찾아줘" → 제너레이터 기반 대용량 처리 코드 제공.

· · · 설치 가이드 · · ·

설치 없이 지금 한 번 써보기

아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.

이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/scikit-bio/SKILL.md

내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)

Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.

↓ 쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
↓ ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/scikit-bio 폴더를 내 ~/.claude/skills/scikit-bio/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/scikit-bio ~/.claude/skills/

⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. 터미널을 열고 저장소를 클론합니다: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  2. 스킬 폴더를 만듭니다: mkdir -p ~/.claude/skills
  3. 이 스킬만 복사합니다: cp -r scientific-agent-skills/skills/scikit-bio ~/.claude/skills/
  4. 파이썬 환경에 라이브러리를 설치합니다: uv pip install scikit-bio (또는 conda install -c conda-forge scikit-bio). Python 3.10+, NumPy 2.0+ 필요.
  5. 선택 사항: 그래프/테이블 연동이 필요하면 uv pip install matplotlib seaborn plotly biom-format polars anndata
  6. Claude Code를 재시작하고 "scikit-bio로 베타 다양성 분석해줘"처럼 요청하면 스킬이 자동 발동합니다.
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT