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PrimeKG 정밀의료 지식그래프 질의

유전자·약물·질환·표현형을 잇는 PrimeKG 지식그래프를 파이썬으로 검색·탐색하게 해주는 스킬입니다.

데이터·분석중급33,0303,248AI 점수 8/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

하버드에서 공개한 정밀의료 지식그래프 PrimeKG(노드 약 12.9만 개, 엣지 약 400만 개, 관계 29종)를 Claude가 직접 질의하도록 만들어 줍니다.

  • search_nodes()로 유전자·단백질·약물·질환·표현형 노드 검색
  • get_neighbors()로 특정 엔티티의 직접 연결 관계 조회(관계 타입 필터 지원)
  • get_disease_context()로 질환별 연관 유전자·약물·표현형을 한 번에 요약
  • drug_protein, disease_gene, disease_phenotype, gwas 등 주요 관계 타입 설명 제공

이런 분께 추천

  • 신약 타깃 발굴·약물 재창출(drug repurposing) 아이디어를 탐색하는 연구자
  • 증상(표현형)과 질환·유전자의 연결고리를 확인해야 하는 바이오/임상 데이터 분석가
  • 네트워크 약리학, 멀티스케일 생물학 과제를 진행하는 대학원생·연구실

활용 예시

  1. "알츠하이머병과 연관된 유전자와 승인 약물을 정리해줘" → get_disease_context("Alzheimer's disease") 결과를 표로 요약
  2. "메트포르민의 타깃 단백질만 보여줘" → get_neighbors(약물ID, relation_type="drug_protein")
  3. "이 질환의 표현형과 겹치는 다른 질환이 있는지 찾아줘" → 표현형 이웃을 역추적해 재창출 후보 경로 탐색

· · · 설치 가이드 · · ·

설치 없이 지금 한 번 써보기

아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.

이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/primekg/SKILL.md

내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)

Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.

쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/primekg 폴더를 내 ~/.claude/skills/primekg/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/primekg ~/.claude/skills/

제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. 터미널을 열고 저장소를 내려받습니다: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  2. 스킬 폴더를 Claude Code 스킬 경로로 복사합니다: mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/primekg ~/.claude/skills/
  3. 파이썬 의존성을 설치합니다: pip install pandas
  4. PrimeKG Harvard Dataverse에서 kg.csv를 내려받습니다(용량이 크니 시간 여유를 두세요).
  5. 데이터 경로를 환경변수로 지정합니다: export PRIMEKG_DATA=/내려받은/경로/kg.csv (문서에 남아 있는 C:\Users\eamon\... 경로는 무시하세요)
  6. Claude Code를 다시 실행한 뒤 "PrimeKG에서 알츠하이머 관련 유전자 찾아줘"처럼 요청하면 스킬이 발동합니다.