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PrimeKG 정밀의학 지식그래프

유전자·약물·질병·표현형을 잇는 PrimeKG 지식그래프를 클로드가 직접 검색하고 분석하게 해주는 스킬.

데이터·분석중급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 6/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

하버드에서 공개한 정밀의학 지식그래프 PrimeKG(약 12.9만 노드, 400만 엣지, 29종 관계)를 Claude Code가 파이썬 스크립트로 질의하도록 만들어 줍니다.

  • search_nodes: 유전자·단백질·약물·질병·표현형 이름으로 노드 ID 검색
  • get_neighbors: 특정 엔티티의 직접 연결 관계(약물-표적, 질병-유전자, GWAS 등) 조회
  • get_disease_context: 한 질병에 연관된 유전자·약물·표현형을 한 번에 요약
  • relation_type 필터로 원하는 근거 유형만 좁혀 보기

이런 분께 추천

  • 표적 발굴·약물 재창출(drug repurposing) 아이디어를 빠르게 탐색하는 신약개발 연구자
  • 증상(표현형)과 질병·유전자의 관계를 정리해야 하는 임상·바이오인포매틱스 연구자
  • 네트워크 약리학, 멀티스케일 생물학 분석을 하는 대학원생 및 데이터 분석가

활용 예시

  1. "알츠하이머병과 연관된 유전자와 승인 약물을 PrimeKG에서 정리해줘" → get_disease_context("Alzheimer's disease") 결과를 표로 요약
  2. "메트포르민의 표적 단백질만 뽑고, 그 단백질이 관여하는 다른 질병을 찾아줘" → drug_protein 관계 필터 + 2단계 이웃 탐색으로 재창출 후보 도출
  3. "이 표현형 목록과 가장 많이 겹치는 희귀질환 후보를 추려줘" → disease_phenotype 관계 기반 겹침 분석

· · · 설치 가이드 · · ·

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
↓ ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/primekg 폴더를 내 ~/.claude/skills/primekg/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/primekg ~/.claude/skills/

⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. 터미널을 열고 저장소를 클론합니다: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  2. 스킬 폴더를 Claude 스킬 디렉터리로 복사합니다: mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/primekg ~/.claude/skills/
  3. 파이썬과 pandas가 필요합니다: pip install pandas
  4. PrimeKG Harvard Dataverse에서 kg.csv를 내려받습니다(용량이 크므로 시간 여유를 두세요).
  5. 데이터 경로를 환경변수로 지정합니다: export PRIMEKG_DATA=/내가/받은/경로/kg.csv (SKILL.md에 남아 있는 윈도우 예시 경로는 무시하세요)
  6. Claude Code를 재시작한 뒤 "PrimeKG에서 알츠하이머 관련 유전자 찾아줘"처럼 요청하면 스킬이 실행됩니다.
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT