PrimeKG 정밀의료 지식그래프 질의
유전자·약물·질환·표현형을 잇는 PrimeKG 지식그래프를 파이썬으로 검색·탐색하게 해주는 스킬입니다.
데이터·분석중급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 8/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.
무엇을 해주나
하버드에서 공개한 정밀의료 지식그래프 PrimeKG(노드 약 12.9만 개, 엣지 약 400만 개, 관계 29종)를 Claude가 직접 질의하도록 만들어 줍니다.
search_nodes()로 유전자·단백질·약물·질환·표현형 노드 검색get_neighbors()로 특정 엔티티의 직접 연결 관계 조회(관계 타입 필터 지원)get_disease_context()로 질환별 연관 유전자·약물·표현형을 한 번에 요약drug_protein,disease_gene,disease_phenotype,gwas등 주요 관계 타입 설명 제공
이런 분께 추천
- 신약 타깃 발굴·약물 재창출(drug repurposing) 아이디어를 탐색하는 연구자
- 증상(표현형)과 질환·유전자의 연결고리를 확인해야 하는 바이오/임상 데이터 분석가
- 네트워크 약리학, 멀티스케일 생물학 과제를 진행하는 대학원생·연구실
활용 예시
- "알츠하이머병과 연관된 유전자와 승인 약물을 정리해줘" →
get_disease_context("Alzheimer's disease")결과를 표로 요약 - "메트포르민의 타깃 단백질만 보여줘" →
get_neighbors(약물ID, relation_type="drug_protein") - "이 질환의 표현형과 겹치는 다른 질환이 있는지 찾아줘" → 표현형 이웃을 역추적해 재창출 후보 경로 탐색
· · · 설치 가이드 · · ·
설치 없이 지금 한 번 써보기
아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.
이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘: https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/primekg/SKILL.md 내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)
Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.
↓ 쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.
Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
- 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
- Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
- Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
Claude Code에 설치
Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요
클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘. GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/primekg 폴더를 내 ~/.claude/skills/primekg/ 에 그대로 복사해줘. 설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.
직접 명령으로 설치하기
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/primekg ~/.claude/skills/⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.
- 터미널을 열고 저장소를 내려받습니다:
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git - 스킬 폴더를 Claude Code 스킬 경로로 복사합니다:
mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/primekg ~/.claude/skills/ - 파이썬 의존성을 설치합니다:
pip install pandas - PrimeKG Harvard Dataverse에서
kg.csv를 내려받습니다(용량이 크니 시간 여유를 두세요). - 데이터 경로를 환경변수로 지정합니다:
export PRIMEKG_DATA=/내려받은/경로/kg.csv(문서에 남아 있는C:\Users\eamon\...경로는 무시하세요) - Claude Code를 다시 실행한 뒤 "PrimeKG에서 알츠하이머 관련 유전자 찾아줘"처럼 요청하면 스킬이 발동합니다.
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT