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NCATS ARAX 바이오메디컬 지식그래프 조회

NCATS Translator ARAX API에 한정된 1홉·2홉 질의를 보내 출처가 명확한 바이오메디컬 관계를 조회하는 스킬입니다.

데이터·분석고급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 8/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

  • NCATS Translator의 ARAX 운영 API에 TRAPI 형식 질의를 보내고, 결과를 request.json / response.json / summary.json으로 남깁니다.
  • 자유 텍스트(예: "primary myelofibrosis")를 CURIE 식별자로 정규화하는 단계를 그래프 질의와 분리해 먼저 검토하게 합니다.
  • 1홉 질의(양 끝 노드 타입 지정, 한쪽 이상 ID 고정)와 양 끝단이 고정된 2홉 질의만 허용해 무분별한 경로 탐색을 막습니다.
  • 기본은 RTX-KG2 단일 조회이며, 사용자가 명시적으로 2~5개 제공자를 지정할 때만 연합(federated) 질의를 수행합니다.
  • 반환된 엣지의 술어·qualifier·1차/집계 출처·논문 정보를 원문 그대로 보존하고, 결과 0건을 "관계 없음"으로 해석하지 않도록 강제합니다.
  • 추론·랭킹·링크 예측·Pathfinder·임상 조언 등은 의도적으로 배제되어 있습니다.

이런 분께 추천

  • 신약 타깃, 유전자-질환 연관 등을 Biolink 모델 기반으로 탐색하는 생명정보학·중개연구 연구자
  • 근거 출처와 재현 가능한 질의 로그가 필수인 문헌·데이터 큐레이션 담당자
  • LLM이 지식그래프 결과를 과장·환각하지 않도록 엄격한 가드레일이 필요한 팀

활용 예시

  1. 약물–유전자 관계 확인: 이매티닙(CHEBI:31690)이 ABL1(NCBIGene:25) 활성에 미치는 감소 방향 효과를 qualifier까지 지정해 1홉 조회.
  2. 약물–유전자–질환 2홉 탐색: 아이바카프토(CHEBI:66901) → Gene → 낭포성 섬유증(MONDO:0009061) 경로를 양 끝단 고정 상태로 조회.
  3. 저장된 결과 재검토: 네트워크 없이 summarize 명령으로 이전 응답의 엣지 바인딩과 출처를 다시 정리해 보고서에 인용.

· · · 설치 가이드 · · ·

설치 없이 지금 한 번 써보기

아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.

이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/ncats-arax/SKILL.md

내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)

Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.

↓ 쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
↓ ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/ncats-arax 폴더를 내 ~/.claude/skills/ncats-arax/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git /tmp/sas && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r /tmp/sas/skills/ncats-arax ~/.claude/skills/

⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. 사전 준비: Python 3.10 이상과 arax.transltr.io로 나가는 HTTPS 접속이 가능해야 합니다. API 키는 필요 없습니다.
  2. 저장소 클론: 터미널에서 git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  3. 스킬 폴더 복사: mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/ncats-arax ~/.claude/skills/
  4. 설치 확인: python ~/.claude/skills/ncats-arax/scripts/arax_client.py preflight 를 실행해 ARAX 서비스와 TRAPI 버전이 정상 인식되는지 확인합니다.
  5. Claude Code 재시작 후 "ARAX로 이 유전자와 약물 관계를 조회해줘"처럼 요청하면 스킬이 활성화됩니다.
  6. 주의: 질의 내용은 공개될 수 있으므로 환자 정보나 미공개 연구 주제는 절대 입력하지 마세요.
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT