NCI 암 영상 데이터 커먼즈(IDC) 탐색기
미국 국립암연구소 공개 암 영상(CT·MR·PET·병리 슬라이드) 데이터를 idc-index로 검색·다운로드·시각화하는 스킬입니다.
데이터·분석중급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 9/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.
무엇을 해주나
미국 국립암연구소(NCI)의 Imaging Data Commons(IDC) 공개 데이터를 idc-index 파이썬 패키지로 다루도록 Claude에게 정확한 사용법을 알려주는 스킬입니다.
- 메타데이터 SQL 조회:
index,collections_index,seg_index,sm_index,clinical_index등 다양한 인덱스 테이블을 SQL로 질의하고 pandas DataFrame으로 받습니다. - DICOM 다운로드: 컬렉션/환자/시리즈 단위 선택 다운로드, 매니페스트 저장,
dirTemplate으로 폴더 구조 정리. - 브라우저 시각화: 로컬 뷰어 없이 OHIF 뷰어 URL을 생성해 바로 확인.
- 라이선스·인용 확인: CC BY / CC BY-NC 구분과 논문용 인용문(APA·BibTeX) 생성.
- 안전 가이드: 시스템 파이썬 강제 설치 금지, 버전 핀 고정(재현성 보장), 사용자 승인 없는 설치 금지 원칙 명시.
- 클라우드 스토리지(S3/GCS), DICOMweb, BigQuery, Parquet 직접 접근 등 상황별 대체 경로도 문서화.
이런 분께 추천
- 의료 AI 학습용 영상 데이터셋을 구축하려는 연구자·대학원생
- 암 종류·모달리티·해부학적 부위 조건으로 영상 서브셋을 뽑아야 하는 분
- 상업적 활용 가능 여부(라이선스)를 사전에 확인해야 하는 기업 연구팀
- 디지털 병리(슬라이드 마이크로스코피)·분할(segmentation) 주석 데이터를 찾는 분
활용 예시
- 폐 CT 학습셋 만들기 — "NLST 컬렉션에서 흉부 CT 중 3D 볼륨이 규칙적으로 정렬된 시리즈만 골라 200개 매니페스트로 저장하고 용량을 먼저 추정해줘"
- 라이선스 안전한 상업용 데이터 — "CC BY-NC가 아닌 컬렉션만 필터링해 뇌 MR 데이터를 다운로드하고 APA 인용문도 만들어줘"
- 분할 주석 매칭 — "seg_index에서 간 분할 데이터를 찾아 원본 CT 시리즈와 조인하고, 대표 케이스는 브라우저 뷰어 링크로 보여줘"
· · · 설치 가이드 · · ·
Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
- 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
- Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
- Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
Claude Code에 설치
Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요
클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘. GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/imaging-data-commons 폴더를 내 ~/.claude/skills/imaging-data-commons/ 에 그대로 복사해줘. 설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.
직접 명령으로 설치하기
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/imaging-data-commons ~/.claude/skills/⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.
- 터미널을 엽니다. (Windows는 PowerShell 또는 WSL)
- 스킬 저장소를 내려받습니다:
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git - Claude 스킬 폴더에 복사합니다:
mkdir -p ~/.claude/skills cp -r scientific-agent-skills/skills/imaging-data-commons ~/.claude/skills/ - 파이썬 가상환경을 만들고 활성화합니다:
python -m venv .venv && source .venv/bin/activate - 테스트된 버전으로 패키지를 설치합니다 (버전 고정 권장):
pip install 'idc-index==0.11.14' pandas pydicom - Claude Code를 재시작한 뒤 "IDC에서 폐 CT 컬렉션 목록 보여줘"처럼 요청하면 스킬이 실행됩니다.
- 첫 실행 시
client.get_idc_version()으로 데이터 버전(v23)을 확인하세요. 다운로드 전에는 반드시 용량과 라이선스를 확인하는 것이 좋습니다.
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT