Claude Skill MartKhám phá skillCâu dùng ngayHọc qua videoDùng terminalSkill là gì?
 
← Về danh sách

Trợ lý trích xuất tile WSI bằng histolab

Skill hướng dẫn dùng histolab để phát hiện vùng mô, trích xuất tile và chuẩn hóa nhuộm từ ảnh lát cắt toàn phần (WSI) trong bệnh học số.

Dữ liệu · Phân tíchTrung cấp★ 33,030⑂ 3,248Điểm AI 8/10Cập nhật lần cuối: 9 thg 8, 2026

Làm được gì

  • Hướng dẫn mở slide bệnh học cỡ gigapixel (.svs...) bằng histolab, kiểm tra thuộc tính, các mức pyramid và thumbnail.
  • Phát hiện vùng mô với TissueMask / BiggestTissueBoxMask và chọn đúng tiler: RandomTiler, GridTiler hoặc ScoreTiler.
  • Tổng hợp quy trình chuẩn bị dataset học sâu: chuẩn hóa nhuộm Macenko/Reinhard, chuỗi filter, xem trước bằng locate_tiles(), xuất báo cáo CSV.
  • Có mục khắc phục sự cố: không trích được tile, quá nhiều tile nền, trích xuất chậm, tile có artifact.

Phù hợp với ai

  • Nhà nghiên cứu, học viên làm AI y tế cần tạo dataset từ ảnh nhuộm H&E.
  • Data engineer lần đầu dựng pipeline tiền xử lý ảnh bệnh học.
  • Người cần kiểm tra chất lượng slide hoặc thống kê độ phủ mô nhanh.

Ví dụ sử dụng

  1. "Trích 100 tile 512×512 ngẫu nhiên từ slide.svs, cố định seed" → sinh mã RandomTiler kèm bước xem trước.
  2. "Phủ toàn bộ vùng mô bằng lưới tile ở level 1 và xuất báo cáo CSV" → quy trình GridTiler + report.
  3. "Màu nhuộm khác nhau giữa các slide làm model kém ổn định" → hướng dẫn chuẩn hóa Macenko và tinh chỉnh tissue_percent.

· · · Hướng dẫn cài đặt · · ·

Dùng thử ngay, không cần cài

Dán đoạn dưới vào Claude là dùng được skill này mà không cần cài đặt.

Hãy đọc hướng dẫn trong tệp này và làm theo để giúp mình:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/histolab/SKILL.md

Mình muốn: (viết việc bạn cần ở đây)

Nếu Claude không mở được liên kết, hãy mở liên kết và copy nội dung vào rồi dán.

↓ Thấy hữu ích thì tải ZIP bên dưới và cài. Sau đó skill tự chạy, không phải dán lại mỗi lần.

Cài vào ứng dụng Claude (không cần terminal)
  1. Tải tệp ZIP bằng nút bên dưới.
  2. Trong Claude, mở Settings → Capabilities và bật 'Code execution and file creation'. (chỉ một lần)
  3. Vào Customize → Skills → + → 'Upload a skill' rồi tải tệp ZIP lên.
↓ Tải ZIP
Cài vào Claude Code

Để Claude làm — dán câu dưới đây vào Claude Code

Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart.
Copy thư mục skills/histolab từ repo GitHub K-Dense-AI/scientific-agent-skills vào ~/.claude/skills/histolab/ của mình.
Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.

Cài bằng lệnh thủ công

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/histolab ~/.claude/skills/

⚠ Đây là skill do người khác tạo. Hãy kiểm tra repo gốc trước khi cài.

  1. Cài thư viện hệ thống OpenSlide trước (macOS: brew install openslide; Ubuntu: sudo apt install openslide-tools). histolab 0.7.0 không hỗ trợ Windows.
  2. Trong môi trường Python 3.8–3.11, chạy pip install histolab (hoặc uv pip install histolab); thêm pip install pooch nếu muốn dùng slide mẫu TCGA.
  3. Clone repo: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git.
  4. Tạo thư mục skill: mkdir -p ~/.claude/skills.
  5. Copy cả thư mục (gồm references/): cp -r scientific-agent-skills/skills/histolab ~/.claude/skills/.
  6. Khởi động lại Claude Code và thử yêu cầu: "dùng histolab trích tile từ WSI này".
Xem mã nguồn trên GitHub ↗Giấy phép: MIT