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DepMap 암 의존성 지도 분석

DepMap의 CRISPR 유전자 의존성·약물 감수성 데이터를 조회·분석해 암 특이적 표적을 검증하는 스킬.

데이터·분석고급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 7/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

  • Broad Institute의 DepMap(Cancer Dependency Map) 데이터를 다루는 방법을 Claude에게 알려줍니다.
  • CRISPR Chronos 유전자 효과 점수, RNAi(DEMETER2), PRISM 약물 감수성 데이터의 의미와 임계값(예: Chronos ≤ −0.5 의존, ≤ −1 강한 의존)을 정리합니다.
  • 선택적 의존성 탐색, 돌연변이-의존성 바이오마커 검정(Mann–Whitney), 공동필수성(co-essentiality) 상관 분석용 파이썬 코드를 제공합니다.
  • 표적 검증 / 합성치사 스크리닝 / 화합물 감수성 분석의 3가지 워크플로와 주요 데이터 파일 목록(CRISPRGeneEffect.csv, sample_info.csv 등)을 안내합니다.

이런 분께 추천

  • 항암 표적 발굴·검증을 하는 신약개발 연구자, 중개연구자
  • 암 유전체·기능유전체 데이터를 다루는 생명정보 분석가
  • 판-에센셜 유전자와 암 선택적 의존성을 구분해야 하는 학위과정 연구자

활용 예시

  1. "KRAS 돌연변이 폐암 세포주에서 특정 유전자가 선택적으로 필수인지 확인해줘" → 세포주 필터링 후 gene effect 비교.
  2. "BRCA1 결손 세포주에서 더 필수적인 유전자를 찾아 합성치사 후보를 뽑아줘" → 돌연변이군 vs 야생형군 비교 및 FDR 보정.
  3. "이 유전자와 의존성 프로파일이 가장 유사한 상위 20개 유전자를 알려줘" → co-essentiality 상관 분석으로 복합체·경로 추론.

· · · 설치 가이드 · · ·

설치 없이 지금 한 번 써보기

아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.

이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/depmap/SKILL.md

내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)

Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.

↓ 쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
↓ ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/depmap 폴더를 내 ~/.claude/skills/depmap/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/depmap ~/.claude/skills/

⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. 터미널을 엽니다.
  2. 저장소를 내려받습니다: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  3. 스킬 폴더를 만듭니다: mkdir -p ~/.claude/skills
  4. 이 스킬만 복사합니다: cp -r scientific-agent-skills/skills/depmap ~/.claude/skills/
  5. 파이썬 의존성을 설치합니다: pip install pandas numpy scipy requests
  6. https://depmap.org/portal/download/all/ 에서 CRISPRGeneEffect.csv, sample_info.csv 등 필요한 파일을 작업 폴더에 다운로드합니다.
  7. Claude Code를 다시 실행한 뒤 "DepMap으로 이 유전자의 암종별 의존성을 분석해줘"처럼 요청하면 스킬이 발동합니다.
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT