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DepMap 암 의존성 지도 분석

DepMap CRISPR 유전자 의존성·약물 감수성 데이터를 조회해 암 특이적 취약점과 표적을 검증하는 스킬.

데이터·분석고급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 7/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

Broad Institute의 Cancer Dependency Map(DepMap) 데이터를 Claude가 다룰 수 있게 해줍니다. CRISPR Chronos 유전자 효과 점수, RNAi(DEMETER2), PRISM 화합물 감수성 데이터를 기준으로 어떤 유전자가 특정 암종에서 필수적인지 판별합니다. Chronos 점수 해석 기준(≤ -0.5 의존 가능, ≤ -1 강한 의존), 세포주 메타데이터 구조, 선택적 의존성 탐색·바이오마커 연관 검정(Mann-Whitney)·공필수성(co-essentiality) 상관 분석 함수가 파이썬 코드로 포함되어 있습니다. 또한 CRISPRGeneEffect.csv, sample_info.csv 등 주요 데이터 파일 목록과 다운로드 경로, 카피수·발현 보정 같은 해석 시 주의사항도 정리되어 있습니다.

이런 분께 추천

  • 종양 표적 발굴·검증을 하는 신약개발 연구자
  • 합성치사(synthetic lethality) 후보를 찾는 암유전체학 연구자
  • 특정 돌연변이 배경에서 취약 유전자를 스크리닝하려는 대학원생·바이오인포매틱스 분석가

활용 예시

  1. "KRAS 돌연변이 폐암 세포주에서 선택적으로 필수적인 유전자를 찾아줘" → 돌연변이 그룹 vs 야생형 그룹 유전자 효과 비교 후 유의 유전자 목록 도출.
  2. "내 표적 유전자가 pan-essential인지 암 선택적인지 판단해줘" → 전체 세포주 분포와 분산을 확인해 약물 표적 적합성 평가.
  3. "특정 유전자와 의존성 프로파일이 가장 유사한 상위 20개 유전자" → 같은 복합체·경로에 속한 공필수 파트너 추정.

· · · 설치 가이드 · · ·

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
↓ ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/depmap 폴더를 내 ~/.claude/skills/depmap/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/depmap ~/.claude/skills/

⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. 터미널을 엽니다.
  2. 저장소를 내려받습니다: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  3. 스킬 폴더를 만듭니다: mkdir -p ~/.claude/skills
  4. depmap 스킬만 복사합니다: cp -r scientific-agent-skills/skills/depmap ~/.claude/skills/
  5. 파이썬 의존성을 설치합니다: pip install pandas numpy scipy requests
  6. https://depmap.org/portal/download/all/ 에서 CRISPRGeneEffect.csv와 sample_info.csv를 작업 폴더에 다운로드합니다(파일이 수백 MB 이상일 수 있습니다).
  7. Claude Code를 재시작하고 "depmap 스킬로 KRAS 의존성 분석해줘"처럼 요청합니다.
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT