Claude Skill MartKhám phá skillCâu dùng ngayHọc qua videoDùng terminalSkill là gì?
 
← Về danh sách

Bộ công cụ sinh học phân tử Biopython

Kỹ năng giúp Claude viết mã Biopython chuẩn xác cho xử lý chuỗi, đọc/ghi tệp, truy vấn NCBI, BLAST, cấu trúc protein và cây phát sinh loài.

Dữ liệu · Phân tíchTrung cấp★ 41,485⑂ 3,824Điểm AI 9/10Cập nhật lần cuối: 31 thg 8, 2026

Làm được gì

  • Tạo và biến đổi chuỗi DNA/RNA/protein (phiên mã, dịch mã, bổ sung ngược) và tính thống kê (GC, khối lượng phân tử, nhiệt độ nóng chảy).
  • Đọc, ghi và chuyển đổi các định dạng FASTA, GenBank, FASTQ, PDB, mmCIF, Newick...
  • Truy cập NCBI (PubMed, GenBank, Protein, Gene) qua Bio.Entrez, kèm quy tắc email/API key và giới hạn tốc độ.
  • Chạy BLAST trên web hoặc cục bộ, phân tích XML kết quả và lọc theo E-value.
  • Phân tích cấu trúc với Bio.PDB (khoảng cách, RMSD, DSSP) và cây phát sinh loài với Bio.Phylo.
  • Có tài liệu tham chiếu tách theo module (references/sequence_io.md, blast.md, structure.md...) để Claude tra cứu trước khi viết mã.

Phù hợp với ai

  • Nhà nghiên cứu, học viên cao học tự xây pipeline tin sinh học.
  • Người làm khoa học sự sống cần xử lý hàng loạt chuỗi hoặc tái lập kết quả bài báo.
  • Nhà phân tích dữ liệu thường xuyên thu thập dữ liệu từ NCBI.

Ví dụ sử dụng

  1. "Tính GC và độ dài cho 3000 chuỗi trong tệp FASTA rồi xuất CSV" → script dùng iterator SeqIO.parse tiết kiệm bộ nhớ.
  2. "Tải trình tự EU490707 từ GenBank và dịch sang protein" → Entrez.efetch + SeqIO.read + translate().
  3. "Dựng cây NJ từ tệp alignment và vẽ dạng ASCII" → DistanceCalculator + DistanceTreeConstructor.nj + Phylo.draw_ascii.

· · · Hướng dẫn cài đặt · · ·

Dùng thử ngay, không cần cài

Dán đoạn dưới vào Claude là dùng được skill này mà không cần cài đặt.

Hãy đọc hướng dẫn trong tệp này và làm theo để giúp mình:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/biopython/SKILL.md

Mình muốn: (viết việc bạn cần ở đây)

Nếu Claude không mở được liên kết, hãy mở liên kết và copy nội dung vào rồi dán.

↓ Thấy hữu ích thì tải ZIP bên dưới và cài. Sau đó skill tự chạy, không phải dán lại mỗi lần.

Cài vào ứng dụng Claude (không cần terminal)
  1. Tải tệp ZIP bằng nút bên dưới.
  2. Trong Claude, mở Settings → Capabilities và bật 'Code execution and file creation'. (chỉ một lần)
  3. Vào Customize → Skills → + → 'Upload a skill' rồi tải tệp ZIP lên.
↓ Tải ZIP
Cài vào Claude Code

Để Claude làm — dán câu dưới đây vào Claude Code

Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart.
Copy thư mục skills/biopython từ repo GitHub K-Dense-AI/scientific-agent-skills vào ~/.claude/skills/biopython/ của mình.
Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.

Cài bằng lệnh thủ công

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git /tmp/scientific-agent-skills && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r /tmp/scientific-agent-skills/skills/biopython ~/.claude/skills/

⚠ Đây là skill do người khác tạo. Hãy kiểm tra repo gốc trước khi cài.

  1. Mở terminal và clone kho: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  2. Tạo thư mục kỹ năng: mkdir -p ~/.claude/skills
  3. Sao chép thư mục kỹ năng: cp -r scientific-agent-skills/skills/biopython ~/.claude/skills/
  4. Cài thư viện Python: uv pip install "biopython==1.87" (nếu chưa có uv thì dùng pip install "biopython==1.87")
  5. Nếu dùng NCBI, đặt biến môi trường: export NCBI_EMAIL="email@cua.ban" và tuỳ chọn export NCBI_API_KEY="..."
  6. Muốn chạy BLAST cục bộ hoặc MUSCLE thì cài riêng các công cụ dòng lệnh đó.
  7. Khởi động lại Claude Code và thử yêu cầu "phân tích tệp FASTA này" để kiểm tra kỹ năng đã nạp.
Xem mã nguồn trên GitHub ↗Giấy phép: MIT