Claude Skill MartKhám phá skillCâu dùng ngayHọc qua videoDùng terminalSkill là gì?
 
← Về danh sách

Hướng dẫn chọn công cụ thiết kế protein binder

Skill giúp chọn giữa BoltzGen, BindCraft, RFdiffusion, Germinal và dựng toàn bộ pipeline thiết kế binder de novo.

Tự động hóaNâng cao★ 163⑂ 29Điểm AI 6/10Cập nhật lần cuối: 1 thg 7, 2026

Làm được gì

  • Cây quyết định chọn công cụ theo loại mục tiêu: protein thường, gắn ligand, peptide/nanobody (VHH)...
  • Bảng so sánh điểm mạnh/điểm yếu của BoltzGen, BindCraft, RFdiffusion, Germinal.
  • Pipeline khuyến nghị: chuẩn bị target → chọn hotspot → BoltzGen → xác thực bằng Chai → lọc QC, kèm file YAML mẫu và lệnh modal run.
  • Ngưỡng lọc cụ thể (pLDDT > 0.80, ipTM > 0.50, PAE_interface < 10, scRMSD < 2.0 Å), số lượng thiết kế mỗi giai đoạn và thời gian tính toán ước lượng.
  • Danh sách lỗi thường gặp: chọn hotspot bị chôn, quá ít thiết kế, chuẩn bị target sai.

Phù hợp với ai

  • Nhà nghiên cứu protein tính toán, nhóm khám phá thuốc sinh học.
  • Người đang dùng RFdiffusion + ProteinMPNN và cân nhắc chuyển sang mô hình all-atom như BoltzGen.
  • Ai cần lập kế hoạch quy mô và lịch trình cho một chiến dịch thiết kế binder trên GPU/Modal.

Ví dụ sử dụng

  1. "Tôi có cấu trúc target PDB, muốn binder 70–100 residue" → skill gợi ý BoltzGen và soạn file binder.yaml.
  2. "Cần thiết kế nanobody VHH" → chuyển hướng sang skill Germinal.
  3. "Sinh 500 backbone rồi validate mất bao lâu?" → dùng bảng số lượng và bảng thời gian để ước tính 1–2 ngày compute.

· · · Hướng dẫn cài đặt · · ·

Dùng thử ngay, không cần cài

Dán đoạn dưới vào Claude là dùng được skill này mà không cần cài đặt.

Hãy đọc hướng dẫn trong tệp này và làm theo để giúp mình:
https://raw.githubusercontent.com/BioTender-max/awesome-bio-agent-skills/HEAD/skills/adaptyv/binder-design/SKILL.md

Mình muốn: (viết việc bạn cần ở đây)

Nếu Claude không mở được liên kết, hãy mở liên kết và copy nội dung vào rồi dán.

↓ Thấy hữu ích thì tải ZIP bên dưới và cài. Sau đó skill tự chạy, không phải dán lại mỗi lần.

Cài vào ứng dụng Claude (không cần terminal)
  1. Tải tệp ZIP bằng nút bên dưới.
  2. Trong Claude, mở Settings → Capabilities và bật 'Code execution and file creation'. (chỉ một lần)
  3. Vào Customize → Skills → + → 'Upload a skill' rồi tải tệp ZIP lên.
↓ Tải ZIP
Cài vào Claude Code

Để Claude làm — dán câu dưới đây vào Claude Code

Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart.
Copy thư mục skills/adaptyv/binder-design từ repo GitHub BioTender-max/awesome-bio-agent-skills vào ~/.claude/skills/binder-design/ của mình.
Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.

Cài bằng lệnh thủ công

git clone https://github.com/BioTender-max/awesome-bio-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r awesome-bio-agent-skills/skills/adaptyv/binder-design ~/.claude/skills/

⚠ Đây là skill do người khác tạo. Hãy kiểm tra repo gốc trước khi cài.

  1. Mở terminal.
  2. Clone kho: git clone https://github.com/BioTender-max/awesome-bio-agent-skills.git
  3. Tạo thư mục skill: mkdir -p ~/.claude/skills
  4. Sao chép: cp -r awesome-bio-agent-skills/skills/adaptyv/binder-design ~/.claude/skills/
  5. Nên chép thêm các skill liên quan (boltzgen, rfdiffusion, bindcraft, germinal, protein-qc, pdb) để liên kết đầy đủ.
  6. Khởi động lại Claude Code và hỏi "chọn công cụ thiết kế binder giúp tôi".
  7. Để chạy thật, bạn cần tài khoản Modal, GPU và các script modal_*.py — hãy chuẩn bị trước.
Xem mã nguồn trên GitHub ↗Giấy phép: NOASSERTION