Claude Skill MartKhám phá skillCâu dùng ngayHọc qua videoDùng terminalSkill là gì?
 
← Về danh sách

Thiết kế binder protein bằng BindCraft

Kỹ năng chạy toàn bộ quy trình thiết kế binder protein bằng BindCraft với kiểm định AF2 tích hợp.

Dữ liệu · Phân tíchNâng cao★ 159⑂ 28Điểm AI 8/10Cập nhật lần cuối: 1 thg 7, 2026

Kỹ năng này làm gì

Từ cấu trúc protein đích (PDB) và các hotspot, kỹ năng hướng dẫn chạy BindCraft để tối ưu đồng thời backbone và trình tự, tạo hàng loạt ứng viên binder. Tài liệu gồm lệnh chạy trên Modal và cài đặt cục bộ, bảng tham số chính (độ dài binder, số design, giao thức fast/default/slow), cấu trúc thư mục output và cách đọc metrics.json, ngưỡng đạt của pLDDT/ipTM, thời gian và chi phí dự kiến, cùng bảng lỗi thường gặp (CUDA OOM, thiếu hotspot, timeout).

Phù hợp với ai

  • Nhà nghiên cứu thực sự chạy các chiến dịch thiết kế binder protein
  • Người cần tiêu chí chọn giữa BindCraft, RFdiffusion, BoltzGen, ColabDesign
  • Người dùng GPU cloud (Modal) muốn dự toán thời gian và chi phí

Ví dụ sử dụng

  • "Chạy 50 design binder dài 70-100aa cho chain A của target.pdb với hotspot A45,A67,A89"
  • "Lọc summary.csv lấy các design có ipTM > 0.5 và tính tỉ lệ đạt"
  • "Gặp lỗi CUDA out of memory thì nên giảm tham số nào?"

· · · Hướng dẫn cài đặt · · ·

Dùng thử ngay, không cần cài

Dán đoạn dưới vào Claude là dùng được skill này mà không cần cài đặt.

Hãy đọc hướng dẫn trong tệp này và làm theo để giúp mình:
https://raw.githubusercontent.com/BioTender-max/awesome-bio-agent-skills/HEAD/skills/adaptyv/bindcraft/SKILL.md

Mình muốn: (viết việc bạn cần ở đây)

Nếu Claude không mở được liên kết, hãy mở liên kết và copy nội dung vào rồi dán.

↓ Thấy hữu ích thì tải ZIP bên dưới và cài. Sau đó skill tự chạy, không phải dán lại mỗi lần.

Cài vào ứng dụng Claude (không cần terminal)
  1. Tải tệp ZIP bằng nút bên dưới.
  2. Trong Claude, mở Settings → Capabilities và bật 'Code execution and file creation'. (chỉ một lần)
  3. Vào Customize → Skills → + → 'Upload a skill' rồi tải tệp ZIP lên.
↓ Tải ZIP
Cài vào Claude Code

Để Claude làm — dán câu dưới đây vào Claude Code

Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart.
Copy thư mục skills/adaptyv/bindcraft từ repo GitHub BioTender-max/awesome-bio-agent-skills vào ~/.claude/skills/bindcraft/ của mình.
Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.

Cài bằng lệnh thủ công

git clone https://github.com/BioTender-max/awesome-bio-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r awesome-bio-agent-skills/skills/adaptyv/bindcraft ~/.claude/skills/

⚠ Đây là skill do người khác tạo. Hãy kiểm tra repo gốc trước khi cài.

  1. Mở terminal và chạy git clone https://github.com/BioTender-max/awesome-bio-agent-skills.git.
  2. Tạo thư mục kỹ năng: mkdir -p ~/.claude/skills.
  3. Sao chép kỹ năng: cp -r awesome-bio-agent-skills/skills/adaptyv/bindcraft ~/.claude/skills/.
  4. Khởi động lại Claude Code và thử yêu cầu "dùng skill bindcraft để thiết kế binder".
  5. Để chạy thật, bạn cần tài khoản Modal cùng repo biomodals (modal_bindcraft.py), hoặc cài BindCraft cục bộ với GPU ≥32GB VRAM và CUDA 11.7+.
  6. Nếu dùng Modal: pip install modal, rồi modal setup để đăng nhập và nạp credit trước khi chạy chiến dịch.
Xem mã nguồn trên GitHub ↗Giấy phép: NOASSERTION