Trợ lý chuẩn dữ liệu BIDS (ảnh não)
Skill giúp tổ chức, truy vấn, kiểm định và chuyển đổi dữ liệu thần kinh học sang chuẩn BIDS.
Dữ liệu · Phân tíchTrung cấp★ 46,134⑂ 4,181Điểm AI 9/10Cập nhật lần cuối: 21 thg 9, 2026
Làm được gì
- Hướng dẫn sắp xếp dữ liệu của 11 modality (MRI, EEG, MEG, iEEG, PET, NIRS, motion capture, hành vi...) theo đúng cây thư mục và quy tắc đặt tên BIDS.
- Truy vấn dataset bằng PyBIDS (
BIDSLayout), kiểm định bằngbids-validator, chuyển DICOM sang BIDS bằng HeuDiConv, dcm2bids hoặc BIDScoin. - Viết
dataset_description.json, sidecar JSON,events.tsv,participants.tsv,scans.tsv, bố cục derivatives; kèm 8 lỗi kiểm định phổ biến với nguyên nhân và cách sửa.
Phù hợp với ai
- Nhà nghiên cứu chuẩn bị công bố hoặc tải dữ liệu lên OpenNeuro, DANDI.
- Người xử lý ảnh cần chuyển DICOM từ máy chụp sang BIDS một cách tái lập được.
- Học viên/nghiên cứu viên cần dataset sạch trước khi chạy fMRIPrep, MRIQC, QSIPrep.
Ví dụ sử dụng
- "Chuyển thư mục DICOM này sang BIDS bằng HeuDiConv rồi kiểm định" → theo trình tự khảo sát → viết heuristic → convert → chạy validator.
- "Tìm file bold task-rest của sub-03 kèm metadata sidecar" → code PyBIDS với bộ lọc entity và kế thừa metadata.
- "Validator báo 'Not a BIDS dataset'" → phát hiện thiếu
dataset_description.jsonở gốc và tạo file tối thiểu.
· · · Hướng dẫn cài đặt · · ·
Dùng thử ngay, không cần cài
Dán đoạn dưới vào Claude là dùng được skill này mà không cần cài đặt.
Hãy đọc hướng dẫn trong tệp này và làm theo để giúp mình: https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/bids/SKILL.md Mình muốn: (viết việc bạn cần ở đây)
Nếu Claude không mở được liên kết, hãy mở liên kết và copy nội dung vào rồi dán.
↓ Thấy hữu ích thì tải ZIP bên dưới và cài. Sau đó skill tự chạy, không phải dán lại mỗi lần.
Cài vào ứng dụng Claude (không cần terminal)
- Tải tệp ZIP bằng nút bên dưới.
- Trong Claude, mở Settings → Capabilities và bật 'Code execution and file creation'. (chỉ một lần)
- Vào Customize → Skills → + → 'Upload a skill' rồi tải tệp ZIP lên.
Cài vào Claude Code
Để Claude làm — dán câu dưới đây vào Claude Code
Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart. Copy thư mục skills/bids từ repo GitHub K-Dense-AI/scientific-agent-skills vào ~/.claude/skills/bids/ của mình. Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.
Cài bằng lệnh thủ công
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/bids ~/.claude/skills/⚠ Đây là skill do người khác tạo. Hãy kiểm tra repo gốc trước khi cài.
- Mở terminal và tạo thư mục skill:
mkdir -p ~/.claude/skills - Tải repo:
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git - Sao chép skill:
cp -r scientific-agent-skills/skills/bids ~/.claude/skills/ - Cài công cụ cần thiết:
uv pip install pybids bids-validator-deno nibabel pydicom(thêmheudiconvhoặcdcm2bidsnếu cần chuyển DICOM). - Khởi động lại Claude Code và thử yêu cầu "kiểm định dataset BIDS của tôi" để skill tự kích hoạt.
Xem mã nguồn trên GitHub ↗Giấy phép: MIT