BIDS 뇌영상 데이터 구조 도우미
신경과학·의생명 데이터를 BIDS 표준으로 정리·검증·변환하도록 돕는 스킬입니다.
데이터·분석중급★ 46,134⑂ 4,181AI 점수 9/10마지막 업데이트: 2026. 9. 21.
무엇을 해주나
- MRI, EEG, MEG, iEEG, PET, NIRS, 모션캡처, 행동 데이터 등 11개 모달리티를 BIDS 표준 디렉터리·파일명 규칙에 맞게 정리하는 방법을 안내합니다.
- PyBIDS(
BIDSLayout)로 피험자·세션·태스크·런 단위 파일 질의,bids-validator로 규격 검증, HeuDiConv·dcm2bids·BIDScoin으로 DICOM→BIDS 변환 절차를 제시합니다. dataset_description.json, JSON 사이드카,events.tsv,participants.tsv,scans.tsv, derivatives 레이아웃 작성 규칙과 자주 나는 검증 오류 8가지의 원인·해결법을 정리합니다.
이런 분께 추천
- OpenNeuro·DANDI 업로드나 논문 데이터 공개를 준비하는 연구자
- 스캐너에서 나온 DICOM을 재현 가능한 파이프라인으로 변환해야 하는 영상 분석 담당자
- fMRIPrep·MRIQC·QSIPrep 같은 BIDS-App을 돌리기 전 데이터셋을 정리해야 하는 대학원생·연구원
활용 예시
- "이 폴더의 DICOM을 HeuDiConv로 BIDS로 변환하고 검증까지 해줘" → 정찰(reconnaissance) → heuristic 작성 → 변환 → validator 실행 순서를 따라 진행.
- "sub-03의 rest 태스크 bold 파일과 사이드카 메타데이터를 찾아줘" → PyBIDS 엔티티 필터와 메타데이터 상속을 이용한 코드 제공.
- "validator가 'Not a BIDS dataset'라고 해" → 루트
dataset_description.json누락 진단 및 최소 필드 생성.
· · · 설치 가이드 · · ·
설치 없이 지금 한 번 써보기
아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.
이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘: https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/bids/SKILL.md 내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)
Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.
↓ 쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.
Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
- 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
- Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
- Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
Claude Code에 설치
Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요
클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘. GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/bids 폴더를 내 ~/.claude/skills/bids/ 에 그대로 복사해줘. 설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.
직접 명령으로 설치하기
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/bids ~/.claude/skills/⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.
- 터미널을 열고 스킬 폴더를 준비합니다:
mkdir -p ~/.claude/skills - 저장소를 내려받습니다:
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git - 이 스킬만 복사합니다:
cp -r scientific-agent-skills/skills/bids ~/.claude/skills/ - 필요한 도구를 설치합니다:
uv pip install pybids bids-validator-deno nibabel pydicom(DICOM 변환이 필요하면heudiconv또는dcm2bids추가) - Claude Code를 다시 실행하고 "BIDS 데이터셋 검증해줘"처럼 요청하면 스킬이 자동으로 발동합니다.
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT