Claude Skill MartKhám phá skillSkill là gì?
 
← Về danh sách

AnnData – Cấu trúc dữ liệu single-cell

Skill hướng dẫn Claude tạo, đọc, ghép và tối ưu dữ liệu AnnData (.h5ad, .zarr) trong hệ sinh thái scverse.

Dữ liệu · Phân tíchTrung cấp★ 33,030⑂ 3,248Điểm AI 8/10Cập nhật lần cuối: 9 thg 8, 2026

Làm được gì

Cung cấp cho Claude kiến thức chuẩn xác về AnnData, cấu trúc dữ liệu nền tảng cho phân tích single-cell.

  • Giải thích X, obs, var, layers, obsm/varm, obsp/varp, uns, raw
  • Đọc/ghi h5ad, zarr, CSV, MTX, Loom; nén gzip và chế độ backed
  • Ghép nhiều dataset bằng ad.concat() với join inner/outer, nhãn batch
  • Subset, view vs copy, chuyển sparse/categorical để tiết kiệm RAM
  • Cảnh báo API đã lỗi thời và hướng dùng anndata.io mới

Phù hợp với ai

  • Nhà nghiên cứu scRNA-seq dùng scanpy, scvi-tools, muon
  • Kỹ sư dữ liệu xử lý file h5ad hàng chục GB
  • Người làm tin sinh cần hợp nhất nhiều batch thí nghiệm

Ví dụ sử dụng

  1. "Mở file 100GB ở chế độ backed, lọc tế bào chất lượng cao rồi xử lý theo từng chunk 1000 dòng."
  2. "Gộp batch1, batch2, batch3 bằng inner join, gắn nhãn batch và chạy hiệu chỉnh combat."
  3. "Giảm dung lượng object AnnData bằng ma trận thưa và categorical, rồi ghi ra h5ad nén gzip."

· · · Hướng dẫn cài đặt · · ·

Cài vào ứng dụng Claude (không cần terminal)
  1. Tải tệp ZIP bằng nút bên dưới.
  2. Trong Claude, mở Settings → Capabilities và bật 'Code execution and file creation'. (chỉ một lần)
  3. Vào Customize → Skills → + → 'Upload a skill' rồi tải tệp ZIP lên.
↓ Tải ZIP
Cài vào Claude Code

Để Claude làm — dán câu dưới đây vào Claude Code

Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart.
Copy thư mục skills/anndata từ repo GitHub K-Dense-AI/scientific-agent-skills vào ~/.claude/skills/anndata/ của mình.
Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.

Cài bằng lệnh thủ công

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git /tmp/scientific-agent-skills && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r /tmp/scientific-agent-skills/skills/anndata ~/.claude/skills/

⚠ Đây là skill do người khác tạo. Hãy kiểm tra repo gốc trước khi cài.

  1. Mở terminal.
  2. Tải repo: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git /tmp/scientific-agent-skills
  3. Tạo thư mục skill: mkdir -p ~/.claude/skills
  4. Sao chép skill: cp -r /tmp/scientific-agent-skills/skills/anndata ~/.claude/skills/
  5. Kiểm tra thư mục references/ đã được sao chép: ls ~/.claude/skills/anndata
  6. Cài thư viện Python (cần Python 3.11+): uv pip install "anndata==0.12.16"
  7. Khởi động lại Claude Code và thử yêu cầu: "Đọc file data.h5ad và lọc ra T cell".
Xem mã nguồn trên GitHub ↗Giấy phép: MIT