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Tamarind Bio 클라우드 분자설계 API

AlphaFold·Boltz·RFdiffusion 등 오픈소스 구조생물학 도구를 로컬 GPU 없이 Tamarind Bio 클라우드(REST/MCP)에서 실행하도록 돕는 스킬입니다.

웹·API 연동고급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 8/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

Tamarind Bio 플랫폼의 관리형 GPU에서 계산생물학 작업을 돌리는 전 과정을 Claude가 대신 처리합니다.

  • 도구 탐색 → 스키마 확인 → 검증 → 제출 → 상태 폴링 → 결과 다운로드의 표준 루프를 그대로 따릅니다.
  • 구조 예측(AlphaFold, Boltz-2, Chai-1, ESMFold), 단백질·바인더·de novo 설계(RFdiffusion, ProteinMPNN, BoltzGen, BindCraft), 항체/나노바디 설계와 developability, 도킹(DiffDock, Autodock Vina), 결합친화도 예측, MSA 생성, 분자동역학까지 커버합니다.
  • REST(x-api-key 헤더)와 MCP 서버(mcp.tamarind.bio/mcp) 두 경로를 모두 안내하고, validateJob로 사전 검증하는 습관을 강제합니다.
  • 실무에서 잘 틀리는 지점(단일 조회는 {jobs:[...]}가 아니라 행 자체 반환, /result는 2단계 다운로드, 배치는 batchStatus로 폴링, 업로드 파일은 이메일 접두사 없이 파일명만 참조)을 명시적으로 경고합니다.

이런 분께 추천

  • 로컬 GPU 없이 단백질 구조 예측·설계를 돌려야 하는 연구자, 바이오텍 개발자
  • 수십~수백 개 서열을 같은 도구로 배치 스크리닝해야 하는 사람
  • 설계 → 폴딩 → 스코어링을 파이프라인으로 엮고 싶은 사람
  • (전제) Tamarind Bio 계정과 API 키, Python 3.10+, 네트워크 접속이 필요합니다. 무료 10잡 이후에는 유료 구독이 필요합니다.

활용 예시

  1. "이 서열을 AlphaFold로 폴딩해줘" → /tools로 스키마 확인 후 submit-job 제출, 30초 간격 폴링, 완료 시 결과 zip 저장.
  2. "ProteinMPNN으로 만든 설계 서열 전부를 검증하고 싶어" → MCP submitBatch(fromJob="my-proteinmpnn-job", type="alphafold")로 한 번에 폴딩, 부모 잡의 batchStatus가 Complete가 될 때까지 대기.
  3. "이 PDB 포켓에 리간드 라이브러리를 도킹해줘" → 타깃 파일 업로드 후 파일명으로 참조, autodock-vina 또는 boltz 중 목적에 맞는 도구를 비교해 선택하고 배치 제출.

· · · 설치 가이드 · · ·

설치 없이 지금 한 번 써보기

아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.

이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/tamarind/SKILL.md

내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)

Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.

↓ 쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
↓ ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/tamarind 폴더를 내 ~/.claude/skills/tamarind/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/tamarind ~/.claude/skills/

⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. 터미널을 엽니다.
  2. 저장소를 내려받습니다: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  3. 스킬 폴더를 만듭니다: mkdir -p ~/.claude/skills
  4. 스킬을 복사합니다: cp -r scientific-agent-skills/skills/tamarind ~/.claude/skills/
  5. app.tamarind.bio에 로그인해 계정 설정에서 API 키를 발급받습니다.
  6. 환경변수를 등록합니다: export TAMARIND_API_KEY="발급받은_키" (셸 설정 파일 ~/.zshrc 등에 추가하면 계속 유지됩니다).
  7. 연결을 확인합니다: curl https://app.tamarind.bio/api/tools -H "x-api-key: $TAMARIND_API_KEY"
  8. Claude Code를 재시작하고 "Tamarind로 이 서열을 폴딩해줘"처럼 요청하면 스킬이 자동 발동합니다.
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT