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pymatgen 재료 구조 분석

pymatgen 최신 API로 결정 구조를 검증·변환·대칭 분석하고, 로컬 상평형도와 Materials Project 조회까지 재현 가능하게 수행하는 스킬.

데이터·분석고급33,0303,248AI 점수 9/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

  • CIF/POSCAR/XYZ/JSON 구조 파일을 경고까지 모두 검사하며 안전하게 읽고, 조성·점유율·산화수·주기성·좌표계를 리포트합니다.
  • symprec, angle_tolerance를 격자 스윕해 공간군 배정의 민감도 보고서를 만들어 톨러런스 장난을 방지합니다.
  • 포맷 변환 시 표현 손실(선택적 동역학, 사이트 속성, 무질서 등)을 사전 계획으로 알려주고, 항상 새 경로에만 씁니다.
  • 로컬 계산 에너지만으로 엄격한 JSON 스키마 기반 상평형도(볼록 껍질) 를 만들고, VASP vasprun.xml·Q-Chem 입출력을 다룹니다.
  • Materials Project 질의는 기본 드라이런이며, --execute 시에만 한 번의 제한된 조회를 수행하고 출처·라이선스·인용을 기록합니다.

이런 분께 추천

  • DFT/계산재료과학 연구자, 대학원생, 재료 데이터 파이프라인 엔지니어
  • 논문·특허용으로 출처와 파라미터를 추적 가능한 구조 분석 기록이 필요한 분
  • Materials Project 데이터를 무분별한 대량 조회 없이 신중하게 쓰고 싶은 분

활용 예시

  1. "이 CIF가 부분 점유율이나 사이트 병합 경고를 내는지 확인해줘" → composition_structure_validator.py structure structure.cif 실행 후 경고·최소 원자간 거리 리포트.
  2. "이 구조의 공간군이 톨러런스에 얼마나 민감한지 보고 싶다" → symmetry_sensitivity_report.py structure.cif --symprec 0.001,0.01,0.1.
  3. "Li-Fe-O 계에서 hull 위 물질을 찾고 싶다" → 먼저 mp_query.py --chemsys Li-Fe-O ... 드라이런 계획 확인 후 승인 시 --execute.

· · · 설치 가이드 · · ·

설치 없이 지금 한 번 써보기

아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.

이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/pymatgen/SKILL.md

내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)

Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.

쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/pymatgen 폴더를 내 ~/.claude/skills/pymatgen/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/pymatgen ~/.claude/skills/

제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. Python 3.11 이상과 uv를 설치합니다.
  2. 터미널에서 저장소를 받습니다: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  3. 스킬 폴더를 복사합니다: mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/pymatgen ~/.claude/skills/
  4. 작업 폴더에서 의존성을 고정 설치합니다: uv init --python 3.11uv add "pymatgen==2026.5.4" "pymatgen-core==2026.7.16" "mp-api==0.46.4"uv sync --frozen
  5. Claude Code를 다시 시작하고 "pymatgen 스킬로 이 CIF를 검증해줘"처럼 요청합니다.
  6. Materials Project를 쓸 경우에만 셸 환경변수 MP_API_KEY를 설정합니다(키를 CLI 인자나 파일에 적지 마세요).