pymatgen 재료 구조 분석
pymatgen 최신 API로 결정 구조를 검증·변환·대칭 분석하고, 로컬 상평형도와 Materials Project 조회까지 재현 가능하게 수행하는 스킬.
데이터·분석고급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 9/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.
무엇을 해주나
- CIF/POSCAR/XYZ/JSON 구조 파일을 경고까지 모두 검사하며 안전하게 읽고, 조성·점유율·산화수·주기성·좌표계를 리포트합니다.
symprec,angle_tolerance를 격자 스윕해 공간군 배정의 민감도 보고서를 만들어 톨러런스 장난을 방지합니다.- 포맷 변환 시 표현 손실(선택적 동역학, 사이트 속성, 무질서 등)을 사전 계획으로 알려주고, 항상 새 경로에만 씁니다.
- 로컬 계산 에너지만으로 엄격한 JSON 스키마 기반 상평형도(볼록 껍질) 를 만들고, VASP
vasprun.xml·Q-Chem 입출력을 다룹니다. - Materials Project 질의는 기본 드라이런이며,
--execute시에만 한 번의 제한된 조회를 수행하고 출처·라이선스·인용을 기록합니다.
이런 분께 추천
- DFT/계산재료과학 연구자, 대학원생, 재료 데이터 파이프라인 엔지니어
- 논문·특허용으로 출처와 파라미터를 추적 가능한 구조 분석 기록이 필요한 분
- Materials Project 데이터를 무분별한 대량 조회 없이 신중하게 쓰고 싶은 분
활용 예시
- "이 CIF가 부분 점유율이나 사이트 병합 경고를 내는지 확인해줘" →
composition_structure_validator.py structure structure.cif실행 후 경고·최소 원자간 거리 리포트. - "이 구조의 공간군이 톨러런스에 얼마나 민감한지 보고 싶다" →
symmetry_sensitivity_report.py structure.cif --symprec 0.001,0.01,0.1. - "Li-Fe-O 계에서 hull 위 물질을 찾고 싶다" → 먼저
mp_query.py --chemsys Li-Fe-O ...드라이런 계획 확인 후 승인 시--execute.
· · · 설치 가이드 · · ·
설치 없이 지금 한 번 써보기
아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.
이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘: https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/pymatgen/SKILL.md 내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)
Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.
↓ 쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.
Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
- 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
- Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
- Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
Claude Code에 설치
Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요
클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘. GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/pymatgen 폴더를 내 ~/.claude/skills/pymatgen/ 에 그대로 복사해줘. 설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.
직접 명령으로 설치하기
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/pymatgen ~/.claude/skills/⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.
- Python 3.11 이상과 uv를 설치합니다.
- 터미널에서 저장소를 받습니다:
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git - 스킬 폴더를 복사합니다:
mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/pymatgen ~/.claude/skills/ - 작업 폴더에서 의존성을 고정 설치합니다:
uv init --python 3.11→uv add "pymatgen==2026.5.4" "pymatgen-core==2026.7.16" "mp-api==0.46.4"→uv sync --frozen - Claude Code를 다시 시작하고 "pymatgen 스킬로 이 CIF를 검증해줘"처럼 요청합니다.
- Materials Project를 쓸 경우에만 셸 환경변수
MP_API_KEY를 설정합니다(키를 CLI 인자나 파일에 적지 마세요).
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT