pydicom DICOM 처리 스킬
pydicom 3.0.2로 DICOM 파일을 안전하게 읽고, 쓰고, 픽셀을 다루며 비식별화 전 점검까지 수행하도록 Claude를 안내하는 스킬입니다.
개발·코딩고급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 9/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.
무엇을 해주나
dcmread()의 안전한 사용법(stop_before_pixels,specific_tags허용목록,defer_size)을 적용해 PHI(환자 식별정보) 노출 없이 메타데이터만 조회하도록 유도합니다.- Transfer Syntax UID 판별, 압축/해제, 캡슐화,
pydicom.pixels의 프레임 단위 디코딩과 Modality LUT → VOI LUT 적용 순서를 정확히 안내합니다. - DICOM PS3.15 Annex E 기반의 9단계 비식별화 워크플로와, 동봉된 헬퍼 CLI(메타데이터 집계, 코덱 사전점검, 프레임/메모리 계획, 감사, UID 매핑 검증)를 상황별로 골라 쓰게 합니다.
- pydicom 3.0 마이그레이션 주의사항(
read_file제거,write_like_original폐기,pixel_data_handlers폐기 등)을 반영합니다.
이런 분께 추천
- 의료영상 연구자·의료 AI 데이터 엔지니어로 DICOM 데이터셋을 대량 정리해야 하는 분
- 병원/연구소에서 반출용 가명화 데이터셋을 만들기 전에 기술 점검이 필요한 분
- JPEG 2000/JPEG-LS/RLE 등 압축 플러그인 배포 환경을 사전 검증해야 하는 개발자
활용 예시
- "이 폴더의 DICOM 시리즈를 모달리티·해상도별로 집계해줘" →
scripts/extract_metadata.py authorized/ --recursive실행으로 값 노출 없는 요약표를 얻습니다. - "이 CT 파일 1번 프레임만 PNG로 뽑아줘" →
pixel_array(path, index=0)+ LUT 적용 흐름 또는dicom_to_image.py --acknowledge-pixel-phi사용. - "반출용 가명화 파일을 만들고 검증해줘" → UID 키 생성 →
anonymize_dicom.py→deidentification_audit.py순서로 진행하며, 원본은 보존하고 결과는 전문가 검증 대상으로 남깁니다.
· · · 설치 가이드 · · ·
설치 없이 지금 한 번 써보기
아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.
이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘: https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/pydicom/SKILL.md 내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)
Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.
↓ 쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.
Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
- 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
- Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
- Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
Claude Code에 설치
Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요
클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘. GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/pydicom 폴더를 내 ~/.claude/skills/pydicom/ 에 그대로 복사해줘. 설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.
직접 명령으로 설치하기
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/pydicom ~/.claude/skills/⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.
- 터미널을 열고 스킬을 둘 폴더로 이동합니다.
- 저장소를 복제합니다:
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git - 스킬 디렉터리를 생성합니다:
mkdir -p ~/.claude/skills - 스킬을 복사합니다:
cp -r scientific-agent-skills/skills/pydicom ~/.claude/skills/ - 파이썬 가상환경을 만들고 활성화한 뒤 고정 버전을 설치합니다:
uv pip install "pydicom==3.0.2" "numpy==2.5.1" "Pillow==12.3.0" - 압축 DICOM을 다뤄야 하면 필요한 플러그인만 추가합니다:
uv pip install "pylibjpeg==2.1.0" "pylibjpeg-libjpeg==2.4.0" "pylibjpeg-openjpeg==2.5.0" - Claude Code를 재시작하고 "DICOM 메타데이터를 점검해줘"처럼 요청해 스킬이 로드되는지 확인합니다.
- 반드시 접근 권한이 있는 로컬 데이터에서만 사용하고, 원본 파일은 별도 보관하세요.
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT