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pydicom DICOM 처리 스킬

pydicom 3.0.2로 DICOM 파일을 안전하게 읽고, 쓰고, 픽셀을 다루며 비식별화 전 점검까지 수행하도록 Claude를 안내하는 스킬입니다.

개발·코딩고급33,0303,248AI 점수 9/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

  • dcmread()의 안전한 사용법(stop_before_pixels, specific_tags 허용목록, defer_size)을 적용해 PHI(환자 식별정보) 노출 없이 메타데이터만 조회하도록 유도합니다.
  • Transfer Syntax UID 판별, 압축/해제, 캡슐화, pydicom.pixels의 프레임 단위 디코딩과 Modality LUT → VOI LUT 적용 순서를 정확히 안내합니다.
  • DICOM PS3.15 Annex E 기반의 9단계 비식별화 워크플로와, 동봉된 헬퍼 CLI(메타데이터 집계, 코덱 사전점검, 프레임/메모리 계획, 감사, UID 매핑 검증)를 상황별로 골라 쓰게 합니다.
  • pydicom 3.0 마이그레이션 주의사항(read_file 제거, write_like_original 폐기, pixel_data_handlers 폐기 등)을 반영합니다.

이런 분께 추천

  • 의료영상 연구자·의료 AI 데이터 엔지니어로 DICOM 데이터셋을 대량 정리해야 하는 분
  • 병원/연구소에서 반출용 가명화 데이터셋을 만들기 전에 기술 점검이 필요한 분
  • JPEG 2000/JPEG-LS/RLE 등 압축 플러그인 배포 환경을 사전 검증해야 하는 개발자

활용 예시

  1. "이 폴더의 DICOM 시리즈를 모달리티·해상도별로 집계해줘" → scripts/extract_metadata.py authorized/ --recursive 실행으로 값 노출 없는 요약표를 얻습니다.
  2. "이 CT 파일 1번 프레임만 PNG로 뽑아줘" → pixel_array(path, index=0) + LUT 적용 흐름 또는 dicom_to_image.py --acknowledge-pixel-phi 사용.
  3. "반출용 가명화 파일을 만들고 검증해줘" → UID 키 생성 → anonymize_dicom.pydeidentification_audit.py 순서로 진행하며, 원본은 보존하고 결과는 전문가 검증 대상으로 남깁니다.

· · · 설치 가이드 · · ·

설치 없이 지금 한 번 써보기

아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.

이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/pydicom/SKILL.md

내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)

Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.

쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/pydicom 폴더를 내 ~/.claude/skills/pydicom/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/pydicom ~/.claude/skills/

제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. 터미널을 열고 스킬을 둘 폴더로 이동합니다.
  2. 저장소를 복제합니다: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  3. 스킬 디렉터리를 생성합니다: mkdir -p ~/.claude/skills
  4. 스킬을 복사합니다: cp -r scientific-agent-skills/skills/pydicom ~/.claude/skills/
  5. 파이썬 가상환경을 만들고 활성화한 뒤 고정 버전을 설치합니다: uv pip install "pydicom==3.0.2" "numpy==2.5.1" "Pillow==12.3.0"
  6. 압축 DICOM을 다뤄야 하면 필요한 플러그인만 추가합니다: uv pip install "pylibjpeg==2.1.0" "pylibjpeg-libjpeg==2.4.0" "pylibjpeg-openjpeg==2.5.0"
  7. Claude Code를 재시작하고 "DICOM 메타데이터를 점검해줘"처럼 요청해 스킬이 로드되는지 확인합니다.
  8. 반드시 접근 권한이 있는 로컬 데이터에서만 사용하고, 원본 파일은 별도 보관하세요.