pydicom DICOM 처리

무엇을 해주나

• 안전한 DICOM 읽기: dcmread()의 stop_before_pixels, specific_tags, defer_size 옵션을 활용해 필요한 태그만 최소로 읽는 패턴을 안내합니다. 전체 Dataset 출력이나 JSON 덤프처럼 PHI(보호대상 건강정보)가 유출되는 습관을 명시적으로 금지합니다.
• 전송 구문·코덱 점검: Transfer Syntax UID 해석, JPEG/JPEG-LS/JPEG 2000/RLE 플러그인(pylibjpeg, pyjpegls, python-gdcm) 설치 조합과 공급망·해시 검증까지 정리합니다.
• 픽셀 데이터 처리: pydicom.pixels의 프레임 단위 디코딩, 배열 shape 규칙, Modality LUT → VOI LUT 적용 순서, MONOCHROME1 반전, Palette Color 처리 등을 다룹니다.
• 압축/해제와 캡슐화: compress(), decompress()가 SOP Instance UID를 새로 생성한다는 점, encapsulate()/generate_frames() 사용법을 설명합니다.
• 비식별화 워크플로: PS3.15 Annex E 기반 9단계 절차와, 원본 보존·시퀀스 재귀 처리·UID 일대일 치환·키(UID 맵) 비밀 관리 원칙을 제공합니다.
• 헬퍼 CLI 7종: 메타데이터 집계, 기술 인벤토리, 코덱 프리플라이트, 프레임/메모리 계획, 단일 프레임 렌더링, 가명화 및 감사, UID 맵 검증 스크립트를 안내합니다.

이런 분께 추천

• 의료 영상 연구 데이터셋을 파이썬으로 전처리하는 연구자·데이터 엔지니어
• PACS/영상 파이프라인을 개발하며 전송 구문과 코덱 의존성을 정리해야 하는 개발자
• 외부 공유 전 DICOM 가명화 절차와 감사 로그를 설계해야 하는 IRB/보안 담당 실무자
• pydicom 2.x 코드를 3.0으로 마이그레이션해야 하는 팀

활용 예시

1. 데이터셋 파악: "authorized/ 폴더의 DICOM 수천 건을 모달리티·해상도·전송 구문별로 집계해줘" → scripts/dicom_inventory.py authorized/ --recursive 실행 후 개별 값 노출 없이 요약 리포트를 받습니다.
2. 디코딩 준비: JPEG 2000으로 압축된 CT 시리즈를 열려는데 오류가 날 때, transfer_syntax_inspector.py로 설치된 플러그인과 지원 UID를 확인하고 필요한 pinned 패키지만 추가 설치합니다.
3. 연구용 가명화: 프로젝트 키를 생성해 anonymize_dicom.py --uid-key-file project.key --uid-scope export-v1로 파생본을 만들고, deidentification_audit.py로 잔여 식별자를 점검한 뒤 전문가 검증을 받습니다.

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/pydicom 폴더를 내 ~/.claude/skills/pydicom/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.