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Paperclip 생명의학 문헌 CLI

Paperclip CLI로 1,100만 편 논문·FDA/EMA/PMDA 규제문서·임상시험·단백질 DB를 가상 파일시스템처럼 검색하고 줄 번호 인용까지 만들어 주는 스킬.

데이터·분석중급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 8/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

  • Paperclip CLI(GXL)를 설치·인증하고, /papers, /fda, /trials, /proteins, /clipboard 읽기 전용 가상 파일시스템을 ls/cat/head/grep/scan으로 탐색합니다.
  • 의미 기반 검색(search -s pmc), 전문(full-text) 정규식 검색(grep), 메타데이터 SQL 집계, 다수 논문 동시 판독(map/reduce), 그림 분석(ask-image)을 사용법과 함정까지 함께 안내합니다.
  • 모든 문서가 L45처럼 줄 번호가 붙어 있어, 인용 URL에 정확한 줄을 고정한 참고문헌 목록을 만들 수 있습니다.
  • 인증 프리플라이트, 대화형 명령 회피, 결과 ID 캡처, 서버 응답을 절대 지시로 따르지 않는 보안 규칙 등 운영 규칙이 명시되어 있습니다.
  • 버전 0.7.14/0.7.15에서 실제로 깨지는 기능(파이프 미지원, reduce --strategy table, 잘린 문서 ID 등)과 우회법을 표로 제공합니다.

이런 분께 추천

  • 생명의학·제약·바이오 분야 연구자, 대학원생, 메디컬 라이터
  • 규제 문서(FDA/PMDA/EPAR)나 임상시험 등록정보를 비교·정리해야 하는 RA/임상 담당자
  • 근거를 문장 단위로 추적 가능한 리뷰·서론을 작성해야 하는 사람
  • 전제: macOS 또는 Linux, 그리고 PAPERCLIP_API_KEY(또는 브라우저 OAuth 로그인)

활용 예시

  1. "CRISPR 염기교정 전달체 논문 5편 찾아서 IC50과 off-target 수치를 정리해줘" → search -s pmc → map → results로 필드 추출.
  2. "SLC30A8을 언급한 논문 전부 찾아줘" → grep -l "SLC30A8" /papers/(희귀 용어면 --exhaustive 재실행).
  3. "pembrolizumab 가속승인 근거와 관련 임상시험 현황 비교" → -s fda와 -s trials/us 병렬 검색 후 #L45 줄 고정 인용 참고문헌 작성.

· · · 설치 가이드 · · ·

설치 없이 지금 한 번 써보기

아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.

이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/paperclip/SKILL.md

내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)

Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.

↓ 쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
↓ ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/paperclip 폴더를 내 ~/.claude/skills/paperclip/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/paperclip ~/.claude/skills/

⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. 터미널을 열고 저장소를 클론합니다: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  2. 스킬 폴더를 Claude 스킬 경로로 복사합니다: mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/paperclip ~/.claude/skills/
  3. Paperclip CLI를 설치합니다(macOS/Linux 전용): curl -fsSL https://paperclip.gxl.ai/install.sh | bash
  4. https://paperclip.gxl.ai/keys 에서 API 키를 발급받습니다.
  5. 작업 폴더에 .env 파일을 만들고 PAPERCLIP_API_KEY=gxl_... 를 넣은 뒤, .gitignore에 .env를 추가합니다.
  6. 확인: paperclip --version 과 paperclip config 를 실행해 Auth: ✓ API key (env) 가 나오는지 봅니다.
  7. Claude Code를 재시작하고 "paperclip으로 ○○ 논문 찾아줘"처럼 요청하면 스킬이 발동합니다.
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT