NeuroKit2 생체신호 연구 워크플로
NeuroKit2로 ECG·EDA·RSP·EEG 등 생체신호를 재현 가능하게 전처리·분석하고 결과를 감사(audit)하도록 돕는 연구용 스킬.
데이터·분석고급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 9/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.
무엇을 해주나
NeuroKit2(고정 버전 0.2.13)를 사용하는 생체신호 연구 파이프라인을 설계·검증·감사해 줍니다.
- 데이터 계약 강제: 샘플링레이트, 단위, 시계(clock)/드리프트, 결측·포화·플랫라인, 이벤트 인덱스 단위(샘플 vs 초)를 처리 전에 기록하게 합니다.
- 전처리 순서 고정: 원신호 보존 → 타임베이스 검증 → 갭 분할 → 모달리티별 클리닝 → 피크/성분 검출 → 품질 확인 → 피크 보정 로깅 → 특징 산출 → 공통 시간축 정렬 → 에포킹 순서를 따릅니다.
- 스키마를 런타임 관측값으로 취급:
ecg_process()등이 반환하는 컬럼/info키를 버전·메서드와 함께 기록하도록 유도합니다. - 번들 CLI 도구 6종: 합성 데이터 생성, 신호 인스펙션, ECG-HRV 파이프라인, EDA 파이프라인, 에포크 플래너, 멀티모달 매니페스트 검증기. URL·심볼릭링크·경로 탈출을 거부하고 실데이터는
--deidentified플래그를 요구합니다. - 해석 가드레일: LF/HF를 교감-부교감 균형으로 단정하지 않기, PPG PRV≠ECG HRV, 짧은 기록에서 VLF/ULF 해석 금지 등 방법론적 주의점을 명시합니다.
이런 분께 추천
- 심리생리학·인지신경과학·웨어러블 연구에서 ECG/HRV, EDA(SCR), 호흡, EOG/EEG 데이터를 분석하는 연구자
- 논문 재현성(버전 고정, 환경 기록, 제외 로그)이 중요한 대학원생·랩 엔지니어
- 남이 작성한 NeuroKit2 코드를 리뷰하거나 감사해야 하는 데이터 사이언티스트
임상 진단, 환자 모니터링, 의료기기 인증 근거로는 사용할 수 없습니다. 개인식별정보(PHI)는 프롬프트·로그·예제에 넣지 마세요.
활용 예시
- HRV 분석 전 점검: "이 250Hz ECG CSV의 시간축과 갭을 먼저 검사한 뒤 시간·주파수·비선형 HRV를 뽑아줘" →
inspect_signal.py로 비단조 시간·플랫라인 확인 후ecg_hrv_pipeline.py실행, 5분 미만 구간의 VLF 해석은 경고 처리. - EDA 분해 방식 명시: "cvxEDA로 SCR을 뽑고 싶은데 기본값과 뭐가 다르지?" → 기본
neurokit은 하이패스 분해임을 알려주고, cvxopt 설치 필요성과amplitude_min이 절대 µS 임계값이 아니라 상대값임을 짚어줍니다. - 멀티모달 정렬 감사: ECG·RSP·EDA를
bio_process()에 넣기 전validate_multimodal.py로 샘플링레이트·단위·클럭 일치를 검증하고, 길이 불일치로 생기는 NaN과 RSA 산출 조건을 점검합니다.
· · · 설치 가이드 · · ·
Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
- 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
- Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
- Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
Claude Code에 설치
Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요
클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘. GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/neurokit2 폴더를 내 ~/.claude/skills/neurokit2/ 에 그대로 복사해줘. 설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.
직접 명령으로 설치하기
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git /tmp/scientific-agent-skills && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r /tmp/scientific-agent-skills/skills/neurokit2 ~/.claude/skills/⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.
- 터미널을 엽니다. Claude Code가 설치되어 있고 Python 3.10 이상,
uv가 준비되어 있는지 확인합니다. - 스킬 저장소를 내려받습니다.
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git - 개인 스킬 폴더를 만들고 이 스킬만 복사합니다.
mkdir -p ~/.claude/skills cp -r scientific-agent-skills/skills/neurokit2 ~/.claude/skills/ - 라이브러리를 고정 버전으로 설치합니다.
(EEG/MNE, cvxEDA, RQA 등 선택 기능은 필요한 패키지만 정확한 버전으로 추가하고uv pip install "neurokit2==0.2.13"uv.lock을 커밋하세요.) - Claude Code를 재시작한 뒤
/skills또는 "neurokit2 스킬 있어?"로 인식 여부를 확인합니다. - 실데이터 없이 먼저 동작을 시험합니다.
python ~/.claude/skills/neurokit2/scripts/generate_synthetic.py --output synthetic.csv --root . --duration 30 --sampling-rate 250 --seed 42 - 실제 녹화 데이터를 쓸 때는 반드시 비식별화 후
--deidentified플래그와 함께 실행하세요.
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