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gget 생물정보학 쿼리 도우미

20개 이상의 유전체 데이터베이스를 gget CLI/Python으로 빠르게 조회하도록 Claude를 안내하는 스킬입니다.

데이터·분석중급33,0303,248AI 점수 9/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

gget 도구를 사용해 Ensembl 유전자 정보, BLAST/BLAT 정렬, PDB·AlphaFold 단백질 구조, Enrichr 농축분석, OpenTargets·COSMIC·cBioPortal 질병/변이 데이터, CELLxGENE 단일세포 데이터, 바이러스 서열 등을 한 인터페이스로 조회하도록 Claude를 지도합니다. 23개 모듈을 6개 카테고리로 정리한 표, 공통 플래그(-o, -csv, -q), 출력 포맷(JSON/CSV/FASTA/PDB/AnnData) 정리, 그리고 모듈별 베스트 프랙티스를 담고 있습니다.

이런 분께 추천

  • 유전자·전사체·단백질 정보를 매번 웹사이트에서 찾기 번거로운 연구자
  • 논문 재현성을 위해 버전 고정(gget==0.30.5)과 결과 저장 습관이 필요한 대학원생·분석가
  • kallisto 등 파이프라인용 참조 파일을 준비해야 하는 NGS 분석 담당자

활용 예시

  • "BRCA1 유전자 정보와 단백질 서열을 가져와 CSV로 저장해줘" → gget searchgget infogget seq 흐름으로 처리
  • "이 유전자 목록으로 GO/KEGG 농축분석 해줘" → gget enrichr에 데이터베이스 단축키를 사용해 결과 표 생성
  • "이 단백질 구조가 PDB에 있는지 먼저 확인하고 없으면 AlphaFold로 예측해줘" → gget pdb 확인 후 gget setup alphafoldgget alphafold 실행

· · · 설치 가이드 · · ·

설치 없이 지금 한 번 써보기

아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.

이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/gget/SKILL.md

내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)

Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.

쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/gget 폴더를 내 ~/.claude/skills/gget/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/gget ~/.claude/skills/

제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. 터미널을 열고 저장소를 클론합니다: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  2. 스킬 폴더를 만듭니다: mkdir -p ~/.claude/skills
  3. gget 스킬만 복사합니다: cp -r scientific-agent-skills/skills/gget ~/.claude/skills/
  4. references/ 폴더의 참고 문서들이 함께 복사됐는지 확인합니다: ls ~/.claude/skills/gget/references
  5. Python 3.9~3.10 가상환경을 만들고 도구를 설치합니다: uv venv .venv && source .venv/bin/activate && uv pip install "gget==0.30.5"
  6. gget --help로 설치를 확인하고, alphafold·cellxgene·elm 모듈을 쓸 경우 gget setup <모듈명>을 한 번 실행합니다.
  7. Claude Code를 재시작한 뒤 "gget으로 TP53 유전자 정보를 조회해줘"처럼 요청하면 스킬이 발동합니다.