gget 생물정보학 쿼리 도우미
20개 이상의 유전체 데이터베이스를 gget CLI/Python으로 빠르게 조회하도록 Claude를 안내하는 스킬입니다.
데이터·분석중급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 9/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.
무엇을 해주나
gget 도구를 사용해 Ensembl 유전자 정보, BLAST/BLAT 정렬, PDB·AlphaFold 단백질 구조, Enrichr 농축분석, OpenTargets·COSMIC·cBioPortal 질병/변이 데이터, CELLxGENE 단일세포 데이터, 바이러스 서열 등을 한 인터페이스로 조회하도록 Claude를 지도합니다. 23개 모듈을 6개 카테고리로 정리한 표, 공통 플래그(-o, -csv, -q), 출력 포맷(JSON/CSV/FASTA/PDB/AnnData) 정리, 그리고 모듈별 베스트 프랙티스를 담고 있습니다.
이런 분께 추천
- 유전자·전사체·단백질 정보를 매번 웹사이트에서 찾기 번거로운 연구자
- 논문 재현성을 위해 버전 고정(
gget==0.30.5)과 결과 저장 습관이 필요한 대학원생·분석가 - kallisto 등 파이프라인용 참조 파일을 준비해야 하는 NGS 분석 담당자
활용 예시
- "BRCA1 유전자 정보와 단백질 서열을 가져와 CSV로 저장해줘" →
gget search→gget info→gget seq흐름으로 처리 - "이 유전자 목록으로 GO/KEGG 농축분석 해줘" →
gget enrichr에 데이터베이스 단축키를 사용해 결과 표 생성 - "이 단백질 구조가 PDB에 있는지 먼저 확인하고 없으면 AlphaFold로 예측해줘" →
gget pdb확인 후gget setup alphafold→gget alphafold실행
· · · 설치 가이드 · · ·
설치 없이 지금 한 번 써보기
아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.
이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘: https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/gget/SKILL.md 내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)
Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.
↓ 쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.
Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
- 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
- Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
- Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
Claude Code에 설치
Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요
클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘. GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/gget 폴더를 내 ~/.claude/skills/gget/ 에 그대로 복사해줘. 설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.
직접 명령으로 설치하기
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/gget ~/.claude/skills/⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.
- 터미널을 열고 저장소를 클론합니다:
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git - 스킬 폴더를 만듭니다:
mkdir -p ~/.claude/skills - gget 스킬만 복사합니다:
cp -r scientific-agent-skills/skills/gget ~/.claude/skills/ references/폴더의 참고 문서들이 함께 복사됐는지 확인합니다:ls ~/.claude/skills/gget/references- Python 3.9~3.10 가상환경을 만들고 도구를 설치합니다:
uv venv .venv && source .venv/bin/activate && uv pip install "gget==0.30.5" gget --help로 설치를 확인하고, alphafold·cellxgene·elm 모듈을 쓸 경우gget setup <모듈명>을 한 번 실행합니다.- Claude Code를 재시작한 뒤 "gget으로 TP53 유전자 정보를 조회해줘"처럼 요청하면 스킬이 발동합니다.
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT