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게놈 인텔리전스 — DNA 서열 예측

유전자 이름·좌표·FASTA만 주면 프로모터, 스플라이스 부위, 인핸서, 크로마틴, 발현량, 유전자 주석을 호스팅 DNA 언어모델로 예측합니다.

데이터·분석중급33,0303,248AI 점수 8/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

Genomic Intelligence(GI)의 클라우드 GPU에서 돌아가는 트랜스포머 기반 DNA 언어모델을 Claude가 대신 호출해 줍니다. 로컬에 모델 가중치나 GPU, 무거운 파이썬 스택이 전혀 필요 없습니다.

지원 태스크는 6가지입니다.

  • promoter — 구간 내 프로모터 영역 탐지
  • splice — 도너/억셉터 스플라이스 부위 예측(장문맥 BigBird)
  • enhancer — 발생·하우스키핑 인핸서 활성 점수(DeepSTARR)
  • chromatin — 수백 개 트랙의 크로마틴 상태(DeepSEA)
  • expression — TSS 중심 9,198bp 창 + 세포주 설명으로 log(TPM+1) 예측
  • annotation — 참조 없이 de-novo 전사체 주석(비동기 잡)

여기에 "구간 내 유전자를 찾고 각각의 발현량까지 예측"하는 복합 워크플로가 더해집니다. 호출 경로는 두 가지로, 키 없이 쓸 수 있는 호스팅 MCP 서버(mcp.genomicintelligence.ai/mcp)와 GI_API_KEY가 필요한 REST /v1 API가 있습니다.

이런 분께 추천

  • 규제 유전체학·전사 조절 연구를 하며 서열 기반 예측 결과를 빠르게 보고 싶은 연구자
  • GPU 세팅 없이 DeepSEA/DeepSTARR류 예측을 시도해 보고 싶은 대학원생·바이오 스타트업 개발자
  • MCP 기반 에이전트에 유전체 분석 도구를 붙이려는 개발자

임상·진단 목적이 아닌 연구개발 용도로만 사용해야 합니다. 로컬 정렬, 변이 콜링, 파일 I/O는 이 스킬의 범위가 아닙니다.

활용 예시

  1. 키 없는 스모크 테스트 — "GI 데모 서열로 프로모터 예측 한번 돌려줘" → load_demo_sequence(name="promoter_tp53")로 핸들을 받고 predict_promoter를 호출.
  2. 유전자 발현 예측 — "HBB를 K562 세포 맥락에서 발현량 예측해줘" → fetch_gene_for_expression(gene="HBB")로 TSS 중심 9,198bp 창을 만들고 predict_expression(description="K562 cells") 실행.
  3. 구간 스캔 + 발현 예측 — "chr11:5,225,000-5,235,000 안의 유전자를 찾고 각 발현량을 알려줘" → fetch_regionfind_genes_and_predict_expression.

· · · 설치 가이드 · · ·

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/genomic-intelligence 폴더를 내 ~/.claude/skills/genomic-intelligence/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git /tmp/sas && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r /tmp/sas/skills/genomic-intelligence ~/.claude/skills/

제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. 터미널을 엽니다.
  2. 저장소를 내려받습니다: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  3. 스킬 폴더를 Claude 스킬 경로로 복사합니다: mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/genomic-intelligence ~/.claude/skills/
  4. (선택) REST API를 쓰려면 contact@genomicintelligence.ai로 키를 요청한 뒤 export GI_API_KEY="gi_발급받은키"를 셸 프로필(~/.zshrc 등)에 추가합니다. 호스팅 MCP 데모는 키 없이도 동작합니다.
  5. REST 경로를 쓸 경우 파이썬 3.10+ 환경에 pip install requests를 설치합니다.
  6. Claude Code를 재시작하고 "TP53 데모 서열로 프로모터 예측해줘"처럼 요청해 스킬이 로드되는지 확인합니다.
  7. 키는 절대 코드에 하드코딩하거나 깃에 커밋하지 마세요.