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FlowIO FCS 파일 리더/라이터

FlowIO 1.4.0으로 유세포분석 FCS 2.0/3.0/3.1 파일의 메타데이터와 이벤트를 안전하게 읽고 FCS 3.1로 쓰는 스킬.

데이터·분석중급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 8/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

  • FCS 2.0/3.0/3.1 파일의 HEADER·TEXT·ANALYSIS 세그먼트와 채널(PnN/PnS) 메타데이터를 점검합니다.
  • 이벤트 데이터를 (이벤트 수, 채널 수) 형태의 NumPy 배열로 추출하고, preprocess=True/False의 의미 차이를 명확히 구분해 사용하도록 안내합니다.
  • $NEXTDATA를 쓰는 레거시 다중 데이터셋 파일을 read_multiple_data_sets()로 읽습니다.
  • create_fcs() / write_fcs()로 FCS 3.1(list-mode, 단정밀도 float) 파일을 생성하거나 복사·비식별화하고, 다시 열어 검증하는 절차까지 규정합니다.
  • 동봉된 scripts/inspect_fcs.py로 파일 크기 제한·메타데이터 전용 모드 등 안전장치가 있는 인벤토리 리포트를 만듭니다.

이런 분께 추천

  • 유세포분석 데이터를 파이썬으로 전처리하는 면역학·생명과학 연구자
  • FCS 파일을 pandas/머신러닝 파이프라인에 넣기 전 구조를 확인해야 하는 데이터 분석가
  • 파일 손상·오프셋 오류·벤더 포맷 결함을 진단해야 하는 코어 랩 엔지니어

활용 예시

  1. "이 폴더의 FCS 파일들 채널 라벨과 이벤트 수만 표로 정리해줘" → only_text=True 또는 인스펙터 스크립트로 메타데이터만 조회.
  2. "NumPy 배열을 FCS 3.1로 저장하고 round-trip 검증까지 해줘" → create_fcs() + 재오픈 후 assert_allclose 검증.
  3. "환자 식별 정보가 담긴 TEXT 필드를 지운 사본을 만들어줘" → write_fcs(..., metadata={...})로 비식별 사본 생성.

· · · 설치 가이드 · · ·

설치 없이 지금 한 번 써보기

아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.

이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/flowio/SKILL.md

내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)

Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.

↓ 쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
↓ ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/flowio 폴더를 내 ~/.claude/skills/flowio/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/flowio ~/.claude/skills/

⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. 터미널을 열고 Python 3.9~3.13과 uv가 설치되어 있는지 확인합니다 (uv --version).
  2. 저장소를 클론합니다: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  3. 스킬 폴더를 만듭니다: mkdir -p ~/.claude/skills
  4. 스킬을 복사합니다: cp -r scientific-agent-skills/skills/flowio ~/.claude/skills/
  5. FlowIO를 설치합니다: uv pip install "flowio==1.4.0" (또는 예시처럼 uv run --no-project --with "flowio==1.4.0" 사용)
  6. Claude Code를 재시작하고 "FCS 파일 메타데이터를 점검해줘"처럼 요청하면 스킬이 발동합니다.
  7. 인스펙터를 직접 쓸 때는 FLOWIO_SKILL_DIR=~/.claude/skills/flowio를 지정한 뒤 python "$FLOWIO_SKILL_DIR/scripts/inspect_fcs.py" sample.fcs를 실행합니다.
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT