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DNAnexus 연동 운영 가이드

dx CLI와 dxpy로 DNAnexus 유전체 분석 워크로드를 안전하고 재현 가능하게 구축·실행·모니터링하도록 돕는 스킬.

개발·코딩고급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 8/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

  • dx CLI와 dxpy SDK를 이용한 로그인, 프로젝트 선택, 파일 업로드/다운로드 등 기본 데이터 작업 절차를 안내합니다.
  • dxapp.json 기반 앱/애플릿 개발, 동봉된 scripts/validate_dxapp.py 오프라인 검증, dx build 빌드 흐름을 정리합니다.
  • 잡(job)·분석(analysis) 실행, dx watch 모니터링, 비용 한도(--cost-limit), 잡 출력 참조를 통한 체이닝을 다룹니다.
  • WDL/CWL(dxCompiler), Nextflow 임포트 등 워크플로 언어 통합 경로를 제시합니다.
  • 토큰 노출 금지, 과금·삭제 전 확인, PHI/TRE 정책 준수 같은 안전 운영 규칙을 강제합니다.

이런 분께 추천

  • DNAnexus 플랫폼에서 유전체·바이오인포매틱스 파이프라인을 운영하는 연구자·엔지니어
  • 사내 DNAnexus 앱을 개발·배포하고 CI 자동화를 붙이려는 개발자
  • 규제 데이터(PHI) 환경에서 실수로 인한 삭제·과금·토큰 유출을 막고 싶은 팀

활용 예시

  1. "결과 폴더의 모든 BAM 파일을 찾아줘" → find_data_objects(name="*.bam", name_mode="glob") 형태로 정확한 글롭 검색 코드를 생성.
  2. "이 애플릿을 비용 25달러 한도로 실행하고 로그를 지켜봐" → dx run ... --cost-limit 25 후 dx watch job-xxxx --get-streams 절차 안내.
  3. "dxapp.json이 최신 규격에 맞는지 확인해줘" → 검증 스크립트를 돌려 deprecated된 runSpec.systemRequirements 등을 지적.

· · · 설치 가이드 · · ·

설치 없이 지금 한 번 써보기

아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.

이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/dnanexus-integration/SKILL.md

내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)

Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.

↓ 쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
↓ ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/dnanexus-integration 폴더를 내 ~/.claude/skills/dnanexus-integration/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/dnanexus-integration ~/.claude/skills/

⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. 터미널을 열고 저장소를 복제합니다: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  2. 스킬 폴더를 만듭니다: mkdir -p ~/.claude/skills
  3. 스킬을 복사합니다: cp -r scientific-agent-skills/skills/dnanexus-integration ~/.claude/skills/
  4. references/와 scripts/ 폴더가 함께 복사됐는지 확인합니다.
  5. DNAnexus 도구를 설치합니다: uv tool install "dxpy==0.410.0" 후 dx --version으로 확인합니다.
  6. dx login으로 로그인하고 dx whoami, dx pwd로 세션을 점검합니다.
  7. Claude Code를 재시작한 뒤 "DNAnexus 프로젝트 파일을 정리해줘"처럼 요청하면 스킬이 활성화됩니다.
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT