Claude Skill MartKhám phá skillCâu dùng ngayHọc qua videoDùng terminalSkill là gì?
 
← Về danh sách

Giám sát biến thể tác nhân gây bệnh (LAPIS)

Truy vấn API GenSpectrum LAPIS theo thời gian thực để biết dòng biến thể nào đang lưu hành, tốc độ tăng và các đột biến kèm nguồn dữ liệu.

Dữ liệu · Phân tíchNâng cao★ 33,030⑂ 3,248Điểm AI 9/10Cập nhật lần cuối: 9 thg 8, 2026

Làm được gì

  • Truy vấn trực tiếp các instance LAPIS công khai (cov-spectrum, genspectrum, pathoplexus) cho SARS-CoV-2, H5N1, cúm, RSV, mpox, sởi, dengue...
  • Không bao giờ viết tên dòng (lineage) theo ký ức: resolve_lineage.py kiểm tra tên còn hiệu lực, bí danh giải ra thành gì, đã bị thu hồi hay đổi tên chưa.
  • lineage_prevalence.py tính tỷ lệ theo tuần ISO kèm khoảng tin cậy Wilson và độ dốc log-odds (chỉ mang tính mô tả, không phải fitness).
  • mutation_profile.py so sánh đột biến gained/lost giữa hai nhóm dòng; chế độ nucleotide phục vụ câu hỏi về primer/probe PCR.
  • reporting_lag.py cho biết dữ liệu gần đây đã đủ tin cậy đến mốc nào.
  • Mọi kết quả đều ghi kèm instance, phiên bản dữ liệu, bộ lọc và khung thời gian để tái lập được.

Phù hợp với ai

  • Nhà nghiên cứu genomic surveillance, chuyên viên dịch tễ và phân tích dữ liệu y tế công cộng.
  • Người thiết kế/kiểm định xét nghiệm PCR cần biết primer còn khớp trình tự đang lưu hành.
  • Người viết báo cáo, bài báo cần xác minh tên dòng và số liệu tỷ lệ trước khi công bố.

Ví dụ sử dụng

  1. "12 tuần qua ở Mỹ dòng nào phổ biến nhất?" → lineage_prevalence.py --top 5 --where country=USA --weeks 12 để khám phá thay vì đoán tên.
  2. Kiểm tra danh sách tên trong bản thảo → resolve_lineage.py XFG.23.1.3 PQ.17 PC.2 phát hiện tên đã bị thu hồi (PC.2 → LF.7.9).
  3. Kiểm tra vùng bám của primer → mutation_profile.py "XFJ*" --versus "XFG*" --nucleotide.

· · · Hướng dẫn cài đặt · · ·

Dùng thử ngay, không cần cài

Dán đoạn dưới vào Claude là dùng được skill này mà không cần cài đặt.

Hãy đọc hướng dẫn trong tệp này và làm theo để giúp mình:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/pathogen-variant-surveillance/SKILL.md

Mình muốn: (viết việc bạn cần ở đây)

Nếu Claude không mở được liên kết, hãy mở liên kết và copy nội dung vào rồi dán.

↓ Thấy hữu ích thì tải ZIP bên dưới và cài. Sau đó skill tự chạy, không phải dán lại mỗi lần.

Cài vào ứng dụng Claude (không cần terminal)
  1. Tải tệp ZIP bằng nút bên dưới.
  2. Trong Claude, mở Settings → Capabilities và bật 'Code execution and file creation'. (chỉ một lần)
  3. Vào Customize → Skills → + → 'Upload a skill' rồi tải tệp ZIP lên.
↓ Tải ZIP
Cài vào Claude Code

Để Claude làm — dán câu dưới đây vào Claude Code

Hãy cài skill mình tìm thấy trên Claude Skill Mart.
Copy thư mục skills/pathogen-variant-surveillance từ repo GitHub K-Dense-AI/scientific-agent-skills vào ~/.claude/skills/pathogen-variant-surveillance/ của mình.
Sau khi cài xong, cho mình biết skill này làm được gì trong một câu.

Cài bằng lệnh thủ công

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/pathogen-variant-surveillance ~/.claude/skills/

⚠ Đây là skill do người khác tạo. Hãy kiểm tra repo gốc trước khi cài.

  1. Mở terminal và kiểm tra Python: python3 --version (cần 3.11+, không cần thư viện ngoài).
  2. Tải repo: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  3. Tạo thư mục skill: mkdir -p ~/.claude/skills
  4. Sao chép skill: cp -r scientific-agent-skills/skills/pathogen-variant-surveillance ~/.claude/skills/
  5. Kiểm tra kết nối API công khai: curl -s https://lapis.cov-spectrum.org/open/v2/sample/databaseConfig | head
  6. Khởi động lại Claude Code, rồi hỏi ví dụ: "Biến thể SARS-CoV-2 nào đang chiếm ưu thế ở Việt Nam?"
  7. Luôn lưu lại thông tin instance, phiên bản dữ liệu và bộ lọc mà script in ra stderr.
Xem mã nguồn trên GitHub ↗Giấy phép: MIT