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protocols.io 연동 도우미

protocols.io의 실험 프로토콜을 안전하게 조회·검증·내보내고, 수정 작업은 실행 없이 계획서로만 만들어 주는 스킬입니다.

웹·API 연동중급★ 33,030⑂ 3,248AI 점수 8/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

  • protocols.io REST API의 최신 엔드포인트(v3/v4가 혼재)를 정확한 경로 표로 정리해, 잘못된 옛 경로 사용을 막습니다.
  • 동봉된 파이썬 CLI로 프로토콜 검색·조회·단계 조회·PDF 내보내기를 수행합니다. 기본은 '계획 모드'이며 --execute를 붙여야 실제 네트워크 요청이 나갑니다.
  • 저장된 JSON을 오프라인으로 검증(필드 타입, 단계 GUID 순서, 버전·저자·DOI 메타데이터)하고, 서버가 준 next_page가 안전한지 확인합니다.
  • 생성·수정·발행·단계 삭제·파일 업로드 같은 변경 작업은 절대 실행하지 않고, 대조 항목과 확인 문구가 포함된 드라이런 계획서만 만듭니다.
  • 토큰은 지정된 환경변수(PROTOCOLS_IO_ACCESS_TOKEN)만 읽고 값은 출력하지 않으며, 공식 호스트로만 HTTPS 요청을 보냅니다.

이런 분께 추천

  • protocols.io에 실험 프로토콜을 보관·인용하는 연구자, 랩 매니저, 코어 시설 담당자
  • 프로토콜 메타데이터(DOI, 버전 URI)를 논문·리포지토리와 연결해야 하는 데이터 큐레이터
  • protocols.io API를 다루는 스크립트를 만들면서 실수로 게시(publish)나 삭제가 나가는 걸 막고 싶은 개발자

활용 예시

  1. python3 -B scripts/protocols_read.py --execute list --query "single cell RNA" --page-size 10 --max-pages 2로 공개 프로토콜을 제한된 범위 안에서 검색.
  2. 아카이브된 특정 버전(protocol-uri/v2)을 조회해 DOI·저자·버전 URI를 그대로 보존한 채 인용 정보를 정리.
  3. 프로토콜 본문 수정 전에 plan_write_request.py --operation update-protocol로 변경 계획서를 뽑아 사람이 검토·승인.

· · · 설치 가이드 · · ·

설치 없이 지금 한 번 써보기

아래를 Claude에 붙여넣으면 설치하지 않고도 이 스킬을 그대로 씁니다.

이 파일의 지시를 읽고 그대로 따라서 나를 도와줘:
https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/HEAD/skills/protocolsio-integration/SKILL.md

내가 원하는 것: (여기에 하고 싶은 일을 쓰세요)

Claude가 링크를 열지 못하면, 링크를 직접 열어 내용을 복사해 붙여넣으세요.

↓ 쓸 만하면 아래에서 ZIP을 받아 설치하세요. 그러면 매번 붙여넣지 않아도 알아서 작동합니다.

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
↓ ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/protocolsio-integration 폴더를 내 ~/.claude/skills/protocolsio-integration/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/protocolsio-integration ~/.claude/skills/

⚠ 제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. 터미널을 열고 Python 버전을 확인합니다: python3 --version (3.11 이상 필요).
  2. 저장소를 내려받습니다: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  3. 스킬 폴더를 만듭니다: mkdir -p ~/.claude/skills
  4. 이 스킬만 복사합니다: cp -r scientific-agent-skills/skills/protocolsio-integration ~/.claude/skills/
  5. (선택) 인증이 필요한 조회를 하려면 protocols.io 개발자 페이지에서 토큰을 발급받아, 셸 설정이나 호스트의 비밀 관리 기능으로 PROTOCOLS_IO_ACCESS_TOKEN 환경변수를 설정합니다. 토큰 값을 채팅창이나 명령 인자에 직접 붙여넣지 마세요.
  6. 스킬 폴더에서 python3 -B scripts/validate_auth_config.py --require read를 실행해 설정이 잡혔는지 확인합니다.
  7. Claude Code를 다시 시작한 뒤 "protocols.io에서 이 프로토콜 버전을 가져와줘"처럼 요청하면 스킬이 작동합니다.
GitHub에서 원본 보기 ↗라이선스: MIT