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LatchBio 워크플로우 연동

Latch 플랫폼에서 생물정보학 워크플로우를 만들고 등록·실행·디버깅하도록 Claude를 안내하는 전문가용 스킬입니다.

개발·코딩고급33,0303,248AI 점수 8/10마지막 업데이트: 2026. 8. 9.

무엇을 해주나

Latch SDK 2.76.8을 기준으로 생물정보학 파이프라인의 전 과정을 Claude가 대신 챙겨줍니다.

  • Python SDK 기반 @workflow / @task 그래프 작성과 타입 지정된 인터페이스 설계
  • Nextflow, Snakemake 파이프라인 패키징 및 등록(latch register, latch develop)
  • CPU·메모리·스토리지·GPU·캐싱·재시도 등 리소스 구성
  • Latch Data(LPath, LatchFile, LatchDir)와 Registry(프로젝트/테이블/레코드) 조작
  • 실행 폼, 런치 플랜, 샘플시트 설계와 Latch MCP를 통한 실행·모니터링

작업 종류에 따라 references/ 하위의 9개 문서 중 필요한 것만 읽도록 라우팅 표를 제공하고, scripts/inspect_latch_sdk.py로 설치된 SDK의 실제 심볼을 검증하게 합니다.

이런 분께 추천

  • Latch 플랫폼에서 파이프라인을 운영하는 생물정보학 엔지니어
  • Nextflow/Snakemake 파이프라인을 클라우드로 옮기려는 연구 조직
  • 워크플로우 등록·디버깅을 반복하며 버전 호환성 문제로 시간을 낭비하는 분

활용 예시

  1. "이 Nextflow 파이프라인을 Latch에 등록할 수 있게 준비해줘" → 엔트리포인트 생성, Dockerfile 확인, latch register --staginglatch develop으로 이미지 검증까지 순서대로 안내
  2. "GPU가 필요한 정렬 태스크로 리소스를 조정해줘" → 이름 있는 태스크 데코레이터 우선 적용, 필요할 때만 custom_task로 전환하고 비용 확인을 먼저 요청
  3. "Registry 테이블의 샘플 목록으로 워크플로우를 배치 실행해줘" → Registry 읽기 → 샘플시트 구성 → launch_v2로 실행, 실행 전 비용·파라미터 확인 요청

· · · 설치 가이드 · · ·

Claude 앱에 설치 (터미널 필요 없음)
  1. 아래 버튼으로 ZIP 파일을 받으세요.
  2. Claude 설정 → Capabilities에서 '코드 실행 및 파일 생성'을 켭니다. (한 번만)
  3. Claude에서 Customize → Skills → + → '스킬 업로드'를 누르고 받은 ZIP을 올립니다.
ZIP 내려받기
Claude Code에 설치

Claude에게 맡기기 — 아래 문장을 Claude Code에 붙여넣으세요

클로드스킬마트에서 찾은 스킬을 설치해줘.
GitHub 저장소 K-Dense-AI/scientific-agent-skills 의 skills/latchbio-integration 폴더를 내 ~/.claude/skills/latchbio-integration/ 에 그대로 복사해줘.
설치가 끝나면 이 스킬로 무엇을 할 수 있는지 한 줄로 알려줘.

직접 명령으로 설치하기

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/latchbio-integration ~/.claude/skills/

제3자가 만든 스킬입니다. 설치 전 원본 저장소를 한 번 확인하세요.

  1. 터미널을 열고 스킬 저장소를 복제합니다: git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git
  2. 스킬 폴더를 Claude Code 스킬 경로로 복사합니다: mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r scientific-agent-skills/skills/latchbio-integration ~/.claude/skills/
  3. Python 환경을 준비합니다(권장 3.12): uv venv --python 3.12 && source .venv/bin/activate
  4. Latch SDK를 버전 고정해 설치합니다: uv pip install "latch==2.76.8"
  5. Latch 계정으로 로그인하고 작업 공간을 선택합니다: latch loginlatch workspace
  6. Claude Code를 재시작한 뒤 "Latch 워크플로우를 등록해줘"처럼 요청하면 스킬이 활성화됩니다.
  7. Windows 사용자는 WSL 환경에서 진행하고, 로컬 이미지 빌드가 필요하면 Docker를 함께 준비하세요.